miR-208基因rs80...位点多态性在广西人群的分布_刘潮.pdf
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1、第 卷第期 年月西 安 交 通 大 学 学 报(医 学 版)()本刊网址:微信公众号:西安交通大学学报医学版基础研究 基因 和 位点多态性在广西人群的分布刘潮,罗艳萍,谷嬉嬉,陈健明,蓝艳,韦叶生(桂林医学院附属医院检验科,广西桂林 ;右江民族医学院附属医院皮肤科,广西百色 )摘要:目的研究 基因 和 在广西健康人群中的分布特点,并将其多态性与其他地区人群的分布进行比较。方法对 例广西健康人群 和 位点采用高通量 技术进行基因分型检测,并将结果与人类基因组计划()公布的不同人群基因多态性数据进行比较。结果在广西健康人群中 位点存在种基因型,为()、()和(),其中、等位基因频率分别为、。位点基
2、因存在种基因型为()、()和(),其中、基因频率为、。将两位点检测结果与 公布的 、及 基因型数据比较,差异均有统计学意义();而与 、相比,两位点基因型和等位基因频率差异均无统计学意义()。位点三种基因型人群血脂之间比较,携带 基因型人群的高密度脂蛋白胆固醇()与组比较,差异具有统计学意义()。结论广西健康人群 基因 和 位点多态性与其他区域存在不同程度差异,位点多态性与 水平高低有关。关键词:;基因多态性;广西人群;血脂中图分类号:文献标志码:,(,;,):,(),(),()(),(),()(),(),(),()():;收稿日期:修回日期:基金项目:国家自然科学基金项目(、);广西自然科学
3、基金项目();桂林医学院硕士研究生科研项目()(,),(),()通信作者:韦叶生,教授 :网络出版时间:网络出版地址:期刘潮,罗艳萍,谷嬉嬉,等 基因 和 位点多态性在广西人群的分布本刊网址:微信公众号:西安交通大学学报医学版 是一类长度为 个核苷酸的内源性非编码小分子 ,通过与靶 的 区特异性结合,从而降解靶 或者抑制其表达。还参与调控细胞增殖、分化与凋亡等多种生物学过程,在机体正常发育、新陈代谢及疾病发生发展等过程中发挥着重要作用。基因作为目前临床心脑血管疾病研究广泛的 之一,其主要机制包括 可以通过与靶基因活化蛋白、细胞程序性死亡蛋白结合,加重心肌细胞凋亡、氧化损伤和自噬,降低 表达能够
4、减轻缺血再灌注损伤心肌细胞氧化应激损伤、炎症反应,从而抑制心肌细胞凋亡、自噬;除了参与体内众多复杂过程的调控外,基因还被证明在短暂性脑缺血发作、心肌梗死和冠心病等多种心脑血管疾病中异常表达,并通过调控机制使这些疾病朝着不同的方向改变。血脂异常是上述多种心脑血管疾病的独立危险因素,早期发现和血脂控制是避免心脑血管疾病发生的重要手段。已有多位学者对不同人群血脂水平与相关基因的单核苷酸多态性()进 行 研 究,而 关 于 基 因 和 位点单核苷酸多态性的研究在国内外尚未查阅到有关的文献报道。因此,本研究对广西健康人群 基因 和 位点采用高通量 技术进行基因分型检测,以探究其在不同种族健康人群中的分布
5、特征,并进一步分析两位点基因多态性与血脂指标的相关性,为今后对 基因在相关疾病进程中的机制研究提供新思路,为群体遗传学在地区的研究提供参考资料,丰富广西人群基因数据库。对象与方法研究对象随机选取 年月至 年月来桂林医学院附属医院体检的无亲缘关系的体检人群 例,其中女性 例,男性 例,年龄 岁,排除患有重大疾病如血液性疾病、肿瘤感染、心脑血管疾病及癌症等。本研究通过本院伦理委员会审批。位点选择依据通过 网站查找 基因多态性情况,尽量选取标签 ();已经被 基因组计划()扫描过的位点;亚洲人群中次要等位基因频率大于 的位点,即 ;经过筛选,最终 基因 、基因 被用于进一步研究。临床样本的采集及处理
6、抽取研究对象晨起静脉血 于 抗凝采血管中,用于全血基因组 提取;另外,采集入组研究对象晨起空腹静脉血 于生化管中,用于血脂生化指标的检测。放入 冰箱保存备用。基因组 提取采用 抗 凝管 收集各体检者静脉 血,血液基因组 提取试剂盒(吸附柱法)购自北京天根生化科技有限公司,并按照其说明书方法提取基因组,将提取的 放置 冰箱分装储存。选取 样本浓度在 范围之间、值在范围之间的合格样本用于后续基因分型实验。引物的设计与合成登录 查 询 基 因 和 的 序 列,引 物 序 列 的 设 计 采 用 在线软件进行设计,将设计好的引物序列交给上海天昊公司公司合成。引物序列如下。:上游 ,下游 :上游 ,下游
7、 。连接和多重荧光 反应及基因分型检测连接反应:反应体系总体积均为,其中包括 缓 冲 液、引物、聚合酶和模板,剩余体积用灭菌双蒸水补足。连接反应参数如下,循环次,。多重荧光 扩增:反应体系总体积 ,其中包括上述连接产物,缓冲液 ,聚合酶,多重荧光扩增引物,灭菌双蒸水。多重荧光 反应参数如下,(每个循环降低),循环次;,循环 次;。基因分型:将上述得到的产物经 稀释 倍并振荡混匀后,取 该混合液与 ,混匀,变性 后在 测序仪上检测,软件分析原始数据。血脂相关指标检测采集各受试者空腹 静脉血,以 离心 ,分离血清,用全自动生化分析仪检测血西 安 交 通 大 学 学 报(医 学 版)第 卷本刊网址:
8、微信公众号:西安交通大学学报医学版清总胆固醇(,)、三酰甘油(,)、高密度脂蛋白胆固醇(,)、低 密 度 脂 蛋 白 胆 固 醇(,)。统计学分析将所得到的实验结果用 软件进行统计分析。其中,采用直接计数法统计两位点的基因型和等位基因频率的分布,之后用 软件对两位点的基因型和等位基因频率的分布用检验来分析,对符合正态分布的血脂等计量资料采用检验,均值标准差(?)表示,为差异有统计学意义。结果 基因 和 研究对象的一般临床资料参与研究的对象一共 名。临床资料见表。表研究对象临床资料 临床资料()基本信息年龄(?)性别(男女)胆固醇()三酰甘油()高密度脂蛋白胆固醇()低密度脂蛋白胆固醇()基因
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