植物RNA聚合酶V的染色质滞留机制_杜璇.pdf
《植物RNA聚合酶V的染色质滞留机制_杜璇.pdf》由会员分享,可在线阅读,更多相关《植物RNA聚合酶V的染色质滞留机制_杜璇.pdf(2页珍藏版)》请在咨信网上搜索。
1、植物RNA聚合酶V的染色质滞留机制杜璇1,杜嘉木2*1.深圳大学医学部,深圳 518060;2.南方科技大学生命科学学院,深圳 518055*联系人,E-mail:Mechanistic insight into the chromatin retention of plant RNApolymerase VXuan Du1&Jiamu Du2*1Shenzhen University Medical School,Shenzhen 518060,China;2School of Life Sciences,Southern University of Science and Technolo
2、gy,Shenzhen 518055,China*Corresponding author,E-mail:doi:10.1360/TB-2023-0269生命体遗传信息从DNA到RNA的传递需要由一类多亚基的RNA聚合酶来完成.在真核生物中,有3种保守的RNA聚合酶,即Pol I(RNA Polymerase I,RNA聚合酶I)、Pol II和PolIII,分别负责核糖体RNA、信使RNA以及转运RNA的合成1.近年来,人们在植物中发现了另外两种植物特有的RNA聚合酶,Pol IV和Pol V,丰富并扩展了人们对RNA聚合酶的认知2,3.Pol IV和Pol V均由Pol II进化而来,共同
3、作为核心组分参与了植物RdRM(RNA-directed DNA methylation,RNA指导的DNA甲基化)通路介导DNA甲基化的发生:在通路上游,Pol IV起始转录产生的单链RNA被RDR2转化为双链,再被DCL3切割成为24-nt的siRNA加载到AGO4上形成复合物3,4;在下游,Pol V与其转录生成的lncRNA(long noncoding RNA,长非编码RNA)共同作为支架与AGO4-siRNA复合物相互作用,进一步招募DRM2介导DNA的甲基化5,6.因此,Pol V在常规地转录生成产物RNA之外,更需要滞留在染色质上起到定位的作用,其动态转录的生化功能与染色质滞留
4、的生理功能之间形成了鲜明的对比.过去几十年,人们已经陆续对酵母和哺乳动物中不同的RNA聚合酶成员在结构和功能方面进行了系统深入的研究7.但是由于Pol IV和Pol V在植物体内的含量较低,对两者的研究,尤其是结构解析的工作一直以来都进展缓慢.近年来,随着Pol IV的结构被报道8,Pol V作为真核RNA聚合酶家族最后一个成员,对其结构与功能的研究仍然是领域内极具挑战的重要工作.近期,我们解析了植物Pol V的高分辨率结构,并结合体外生化实验,阐明了Pol V的染色质滞留机制,相关工作发表于Science9.为了得到Pol V样品,我们首先筛选并获取了与Pol V大亚基NRPE1高亲和力结合
5、的单克隆抗体,通过抗体富集并纯化了花椰菜(Brassica oleracea var.botrytis)花序中的Pol V,最终利用冷冻电子显微镜技术解析了Pol V及其转录延伸复合物(Pol V-EC)的结构(图1(a).整体上,Pol V呈现出典型的RNA聚合酶家族的复合物构象.与家族中其他成员相比,PolV在亚基组成以及关键元件上都表现出了显著区别.首先,Pol V缺失了经典Pol II相关转录因子的结合区域;NRPE9亚基的位置和构象与在Pol II中明显不同;此外,Pol V的TriggerLoop相对于Pol II来讲更加紧凑而缺乏摆动性,可能是Pol V较低转录活性的因素之一.尽
6、管Pol V是由Pol II进化而来,但是它的转录活性相对减弱,而保真性则显著增强,其分子机制仍然不清楚.在Pol V转录延伸复合物结构中,非模板链DNA被Pol V NRPE2亚基的Lobe和Fork结构域紧紧抓住(图1(b).其中Fork结构域的Tyr495伸入到双链DNA下游的分叉处,并与即将打开的碱基对形成疏水的堆积作用,同时与模板链的磷酸基团形成氢键(图1(c),增强了Pol V对转录泡的稳定作用.体外转录实验表明,Pol V相对于Pol II的转录活性明显降低,并在双链DNA下游分叉处有显著的转录停顿现象.转录停顿现象是RNA聚合酶在转录中引起回溯(backtracking)从而引
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 植物 RNA 聚合 染色质 滞留 机制 杜璇
1、咨信平台为文档C2C交易模式,即用户上传的文档直接被用户下载,收益归上传人(含作者)所有;本站仅是提供信息存储空间和展示预览,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对上载内容不做任何修改或编辑。所展示的作品文档包括内容和图片全部来源于网络用户和作者上传投稿,我们不确定上传用户享有完全著作权,根据《信息网络传播权保护条例》,如果侵犯了您的版权、权益或隐私,请联系我们,核实后会尽快下架及时删除,并可随时和客服了解处理情况,尊重保护知识产权我们共同努力。
2、文档的总页数、文档格式和文档大小以系统显示为准(内容中显示的页数不一定正确),网站客服只以系统显示的页数、文件格式、文档大小作为仲裁依据,平台无法对文档的真实性、完整性、权威性、准确性、专业性及其观点立场做任何保证或承诺,下载前须认真查看,确认无误后再购买,务必慎重购买;若有违法违纪将进行移交司法处理,若涉侵权平台将进行基本处罚并下架。
3、本站所有内容均由用户上传,付费前请自行鉴别,如您付费,意味着您已接受本站规则且自行承担风险,本站不进行额外附加服务,虚拟产品一经售出概不退款(未进行购买下载可退充值款),文档一经付费(服务费)、不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
4、如你看到网页展示的文档有www.zixin.com.cn水印,是因预览和防盗链等技术需要对页面进行转换压缩成图而已,我们并不对上传的文档进行任何编辑或修改,文档下载后都不会有水印标识(原文档上传前个别存留的除外),下载后原文更清晰;试题试卷类文档,如果标题没有明确说明有答案则都视为没有答案,请知晓;PPT和DOC文档可被视为“模板”,允许上传人保留章节、目录结构的情况下删减部份的内容;PDF文档不管是原文档转换或图片扫描而得,本站不作要求视为允许,下载前自行私信或留言给上传者【自信****多点】。
5、本文档所展示的图片、画像、字体、音乐的版权可能需版权方额外授权,请谨慎使用;网站提供的党政主题相关内容(国旗、国徽、党徽--等)目的在于配合国家政策宣传,仅限个人学习分享使用,禁止用于任何广告和商用目的。
6、文档遇到问题,请及时私信或留言给本站上传会员【自信****多点】,需本站解决可联系【 微信客服】、【 QQ客服】,若有其他问题请点击或扫码反馈【 服务填表】;文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“【 版权申诉】”(推荐),意见反馈和侵权处理邮箱:1219186828@qq.com;也可以拔打客服电话:4008-655-100;投诉/维权电话:4009-655-100。