安徽铜陵地区首例血流感染耳念珠菌的耐药性及溯源分析.pdf
《安徽铜陵地区首例血流感染耳念珠菌的耐药性及溯源分析.pdf》由会员分享,可在线阅读,更多相关《安徽铜陵地区首例血流感染耳念珠菌的耐药性及溯源分析.pdf(6页珍藏版)》请在咨信网上搜索。
1、临床输血与检验2023年10月第25卷第5期667论著安徽铜陵地区首例血流感染耳念珠菌的耐药性及溯源分析*潘恺1 陈继中1 王中新2 胡志军1 朱娟娟11安徽省铜陵市人民医院,安徽铜陵 244000,2安徽医科大学第一附属医院,安徽合肥 230000DOI:10.3969/j.issn.1671-2587.2023.05.015*本课题受铜陵市科技计划项目(No.20200203038)资助作者简介:潘恺,主要从事病原微生物检验研究,(E-mail)。通信作者:王中新,主要从事病原微生物检验研究,(E-mail)。【摘要】目的 报道安徽铜陵地区首例血流感染耳念珠菌一例,并对该菌株的耐药性和来源
2、情况进行分析。方法 采用质谱和基因测序技术,对安徽省某三级医院重症监护室(ICU)一名血液感染患者的耳念珠菌株进行鉴定并分析其对多种药物的耐药性、菌种来源和毒力。结果 药敏试验提示本例耳念珠菌对唑类及多烯类抗真菌药物均耐药,对5-氟胞嘧啶敏感。全基因组测序检出ERG11基因和CDR1基因发生了突变,前者132号位由酪氨酸突变为苯丙氨酸,后者709号氨基酸由谷氨酸突变为天冬氨酸。麦角甾醇通路相关基因ERG1、ERG2、ERG6、ERG13未检测出突变。通过比较内部转录间隔区(ITS)序列得出的系统发生树显示,与我们分离的菌株关系最密切的菌株是印度菌株。结论 本例耳念珠菌造成的血流感染为安徽省内首
3、次报道,质谱和基因测序能够准确鉴定耳念珠菌。此外,全基因组测序能够深入分析耳念珠菌的高度耐药性、菌种来源和高毒力性。【关键词】耳念珠菌 血流感染 耐药性 基因测序 【中图分类号】R446.5 【文献标识码】A 【文章编号】1671-2587(2023)05-0667-06Drug Resistance and Source Analysis of the First Case of Bloodstream Infection Blood Stream Infection with Candida Auris in Tongling,Anhui Province PAN Kai,CHEN Jiz
4、hong,WANG Zhongxin,et al.Tongling Peoples Hospital Tongling AnHui 244000【Abstract】Objective The first case of blood stream infection with Candida auris in Tongling of Anhui province was reported,the drug resistance and source of the strain were analyzed.Methods MS and gene sequencing were used to id
5、entify the strain of Candida auris from a patient with blood infection in the intensive care unit(ICU)of a tertiary hospital in Anhui Province,China,and its resistanceto various drugs,bacterial origin and virulence were analysed.Results The drug sensitivity test showed that the fungus was resistant
6、to azoles and polyene,but sensitive to 5-fluorocytosine.Mutations in ERG11 and CDR1 were found in the whole genome sequencing.The former mutated from tyrosine to L-Phenylalanine at position 132 and the latter mutated from glutamate to L-Aspartic Acid at position 709.No mutation was detected in ergos
7、terol pathway related genes ERG1,ERG2,ERG6,Erg13.In addition,a phylogenetic tree drawn by comparing Internally Transcribed Spaer(ITS)sequences revealed that the strain with the closest relationship to the strains we isolated was the Indian strain.Conclusion This is the first report of blood stream i
8、nfection caused by Candida auris in Anhui Province.MS and gene sequencing enable accurate identification of Candida auris.In addition,gene sequencing enables in-depth analysis of the species origin,resistance to multiple drugs,and high virulence of Candida auris.【Key words】Candida auris Bloodstream
9、infection Drug resistance Gene sequencing 耳念珠菌由日本在2009年首次报道,分离于一名患者外耳道内而得名,其对临床常规抗真菌感染治疗药物的高度耐药性和高致死率,易引起医院内感染暴发事件发生,因此被称为“超级真菌”1-2,目前质谱系统和基因测序具有较高的精准性,广泛应用于临床的病原微生物菌种鉴定,本文应用该方法对中国安徽省某三甲医院重症医学科一例血流感染耳念珠菌患者的病例进行分析报道。资料与方法1 一般资料男性患者,77岁,2021年9月21日因“颈椎椎体手术后突发呼吸心跳骤停”转入重症监护病房,入院诊断为(1)呼吸心跳骤停,(2)缺血缺氧性脑病后遗症
10、,(3)2型糖尿病,(4)高血压,(5)高脂血症。入住重症监护病房后予以机械通气、维持血压、脑保护、抗细菌感染等治疗,患者入院后一直处于浅 J Clin Transfus Lab Med,October.2023,Vol 25,No.5668昏迷状态,长期鼻饲、留置导尿管。血液、呼吸、心血管系统查体未见异常。2022年5月22日6月1日因痰培养和中段尿培养检出泛耐药肺炎克雷伯菌及泛耐药鲍曼不动杆菌先后调整哌拉西林-他唑巴坦、美罗培南、替加环素三种抗菌药物抗细菌感染治疗。抗细菌感染期间,真菌(1,3)-D葡聚糖试验结果未见异常(60 pg/mL)。6月2日(1,3)-D葡聚糖的检测结果为150.
11、10 pg/mL,提示患者深部真菌感染。2022年6月5日患者复查真菌(1,3)-D葡聚糖检测结果为220.40 pg/mL。同日送检的血液培养及静脉导管细菌培养均于6月6日报阳,随即抽取血培养瓶中的培养基转种哥伦比亚血琼脂平板和沙堡弱斜面琼脂并涂片革兰染色,涂片可见酵母样真菌孢子,见图1,支持酵母样真菌血流及导管感染判断。6月8日临床科室经验治疗给予卡泊芬净50 QD静脉滴注治疗方案,6月15日再次送检双侧双瓶血液培养依然检出耳念珠菌。该患者基础性疾病多,多器官功能衰竭,长期卧床,免疫力低下,耳念珠菌的高毒力表现和多重耐药性导致抗真菌治疗效果不佳,患者于6月23日临床死亡。2 仪器和试剂 血
12、液培养仪使用BD BACTEC FX全自动培养系统;菌株鉴定使用生物梅里埃的VITEK 2 COMPACT全 自 动 微 生 物 鉴 定 系 统 和 重 庆 中 元 公 司 产 品 的EXS1000全自动微生物飞行时间质谱鉴定系统;沙堡弱琼脂培养基、血琼脂平板和CHROmagar念珠菌显色平板选用江门市凯林贸易有限公司产品,真菌(1,3)-D葡聚糖检测试剂盒(光度法)使用北京金山川科技发展有限公司产品。3 方法 真 菌 菌 种 鉴 定 使 用 飞 行 时 间 质 谱 系 统 的 甲酸 裂 解 法3-4;本 研 究 中 使 用 的 其 他 耳 念 珠 菌 的内 部 转 录 间 隔 区(ITS)序
13、 列 均 来 自 于NCBI的Blast数据库;一代测序委托安徽合肥金域医学检验实验室进行检测,使用引物ITS1及ITS4的序列分别为5-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3和5-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3;全基因组测序委托上海生工生物工程公司检测;系统发育树使用MEGA7.0软件进行绘制。注:革兰染色1 000,可见酵母样真菌孢子。图1 血培养直接涂片结 果1 VITEK2和质谱系统鉴定结果 抽取血培养瓶样本转种在血琼脂平板和沙堡弱斜面琼脂上,二者分别置于36和28下进行培养,18 h后两培养基表面均可见乳白色奶油状凸起菌落生长。随即使用VITEK2的YST酵母菌鉴定
14、卡鉴定,得出的结果为耳念珠菌,置信度99%。同时挑取沙堡弱上单个菌落使用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱系统(MALDI-TOF MS)鉴定为耳念珠菌,鉴定得分为2.23。2 CHROmagar念珠菌显色平板颜色变化平板置于28培养24 h和48 h后均呈乳白色,菌落在72 h后开始显现出浅粉红色,显色结果见图2。3 药敏试验结果 我们将测得的药敏试验数据和中国境内已报道的5例耳念珠菌(厦门2例XM1803、XM1805,北京3例C1921、C1922、BJCA001)5-6进行了对照,见表临床输血与检验2023年10月第25卷第5期669图2 CHROmagar念珠菌显色培养基24、48、7
15、2 h显色结果表1 药敏试验结果比对MIC(g/mL)FLCITCVRC5-FCAMBAHTLCA0011280.58=42XM18031280.5 0.50.1252XM18051280.5 0.50.1252C1921128 0.25 0.50.1252C1922128 0.25 0.50.1252BJCA001 2 0.0300.06 0.25注:FLC fluconazole,ITC itraconazole,VRC voriconazole,AMB amphotericin B,5-FC 5-flucytosine。表2 耐药基因序列检测比对结果抗真菌药物耐药基因参考序列检测结果耐药
16、机制唑类ERG11GCA_002759435.2132号位酪氨酸突变为苯丙氨酸Y132F、K143R热点突变对唑类耐药CDR1GCA_002759435.2709号位谷氨酸突变为天冬氨酸缺失会导致对氟康唑的敏感性提高多烯类ERG1GCA_002759435.2未检出突变麦角甾醇通路相关的4个基因ERG2GCA_002759435.2未检出突变ERG6GCA_002759435.2未检出突变ERG13GCA_002759435.2未检出突变核苷类FUR1NW-021640165.1未见突变基因序列F211I基因突变会产生耐药1,VITEK2药物敏感试验提示该例真菌对唑类及多烯类抗真菌药物均耐药,
17、仅对5-氟胞嘧啶敏感。4 耐药基因比对结果 为了解该菌的耐药机制,我们将与该菌有关的耐药基因序列7和参考序列进行了比对,敏感菌参考序列来自NCBI数据库,结果见表2。5 系统发育树对该菌进行一代测序鉴定后将基因测序结果输入BLASTN数据库进行比对,通过比对我们发现该菌株ITS区域基因序列与2017年南非上传至BLASTN数据库的分离株(KY656976)、2017年印度分离株(MK108049)、2022年印度分离株(ON331802)以及2022年印度分离株(ON331807)的基因序列具有100%的相似度。之后我们继续使用ITS区域的序列进行了系统发育树绘制用于分析该菌株的来源情况,我们
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 安徽 铜陵 地区 首例 血流 感染 念珠菌 耐药性 溯源 分析
1、咨信平台为文档C2C交易模式,即用户上传的文档直接被用户下载,收益归上传人(含作者)所有;本站仅是提供信息存储空间和展示预览,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对上载内容不做任何修改或编辑。所展示的作品文档包括内容和图片全部来源于网络用户和作者上传投稿,我们不确定上传用户享有完全著作权,根据《信息网络传播权保护条例》,如果侵犯了您的版权、权益或隐私,请联系我们,核实后会尽快下架及时删除,并可随时和客服了解处理情况,尊重保护知识产权我们共同努力。
2、文档的总页数、文档格式和文档大小以系统显示为准(内容中显示的页数不一定正确),网站客服只以系统显示的页数、文件格式、文档大小作为仲裁依据,平台无法对文档的真实性、完整性、权威性、准确性、专业性及其观点立场做任何保证或承诺,下载前须认真查看,确认无误后再购买,务必慎重购买;若有违法违纪将进行移交司法处理,若涉侵权平台将进行基本处罚并下架。
3、本站所有内容均由用户上传,付费前请自行鉴别,如您付费,意味着您已接受本站规则且自行承担风险,本站不进行额外附加服务,虚拟产品一经售出概不退款(未进行购买下载可退充值款),文档一经付费(服务费)、不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
4、如你看到网页展示的文档有www.zixin.com.cn水印,是因预览和防盗链等技术需要对页面进行转换压缩成图而已,我们并不对上传的文档进行任何编辑或修改,文档下载后都不会有水印标识(原文档上传前个别存留的除外),下载后原文更清晰;试题试卷类文档,如果标题没有明确说明有答案则都视为没有答案,请知晓;PPT和DOC文档可被视为“模板”,允许上传人保留章节、目录结构的情况下删减部份的内容;PDF文档不管是原文档转换或图片扫描而得,本站不作要求视为允许,下载前自行私信或留言给上传者【自信****多点】。
5、本文档所展示的图片、画像、字体、音乐的版权可能需版权方额外授权,请谨慎使用;网站提供的党政主题相关内容(国旗、国徽、党徽--等)目的在于配合国家政策宣传,仅限个人学习分享使用,禁止用于任何广告和商用目的。
6、文档遇到问题,请及时私信或留言给本站上传会员【自信****多点】,需本站解决可联系【 微信客服】、【 QQ客服】,若有其他问题请点击或扫码反馈【 服务填表】;文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“【 版权申诉】”(推荐),意见反馈和侵权处理邮箱:1219186828@qq.com;也可以拔打客服电话:4008-655-100;投诉/维权电话:4009-655-100。