弓形虫ROP5与ROP18的双基因缺失株构建及表型鉴定.pdf
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1、收稿日期:2020-10-10基金项目:上海市科技兴农项目(沪农科创字(2019)第 3-3 号)作者简介:陈芸,女,博士研究生,预防兽医学专业通信作者:王权,E-mail:研究论文弓形虫ROP5与ROP18的双基因缺失株构建及表型鉴定摘 要:ROP5与ROP18都是弓形虫重要的毒力因子,本研究旨在构建弓形虫RH株ROP5单基因缺失株,在此基础上构建ROP5与ROP18的双基因缺失株,并研究ROP5基因、ROP18基因的表型功能,为探究两个基因的协同作用奠定基础。首先构建质粒pSAG1:CAS9:TgU6:sgROP5、pROP5:DHFR-D质粒,并将质粒电转至弓形虫RH株速殖子,经息疟定筛
2、选及PCR鉴定;再将质粒pSAG1:CAS9:TgU6:sgROP18、pROP18:CAT-D电转至鉴定正确的ROP5单基因缺失株(ROP5-KO)速殖子中,经氯霉素筛选并进行PCR鉴定。结果显示:本试验成功获得ROP5-KO株及ROP5与ROP18的双基因缺失株(ROP5/ROP18-KO);两个基因同时缺失可明显降低弓形虫的入侵能力及生长速度;此外,双基因缺失后,弓形虫对小鼠的毒力明显减弱。本研究表明,同时敲除ROP5基因与ROP18基因后,弓形虫毒力显著降低,为进一步探究ROP5与ROP18的协同作用奠定了基础。关键词:弓形虫;CRISPR/Cas9;基因敲除;ROP5基因;ROP18
3、基因中图分类号:S852.72 文献标志码:A 文章编号:1674-6422(2023)03-0001-11Construction and Phenotype Identifi cation of ROP5 and ROP18 Double Gene Deletion Strain of Toxoplasma gondii CHEN Yun,LIU Qi,ZHANG Manyu,GENG Xiaoling,JIANG Wei,WANG Quan(Shanghai Veterinary Research Institute,CAAS,Shanghai 200241,China)陈 芸,刘 旗,
4、张曼玉,耿小玲,蒋 蔚,王 权(中国农业科学院上海兽医研究所,上海 200241)Abstract:ROP5 and ROP18 are important virulence factors of Toxoplasma gondii.The fi rst step of the present study was to construct a ROP5 gene knockout strain and then make a double gene deletion strain of ROP5 and ROP18 for evaluation of effects of ROP5 and
5、ROP18 deletions on T.gondii virulence.First of all,the pSAG1:CAS9:TgU6:sgROP5 plasmid and pROP5:DHFR-D plasmid were constructed and co-transfected into tachyzoites followed by pyrimethamine screening and PCR verification.The pSAG1:CAS9:TgU6:sgROP18 and pROP18:CAT-D plasmids were electro-transferred
6、into the correctly identifi ed ROP5-KO,and then screened with chloramphenicol and identifi ed by PCR.The results of invasion,proliferation and plaque assay showed that the double-deletion of two genes signifi cantly reduced the invasive ability and growth rate of T.gondii as compared with wild strai
7、ns.In addition,the virulence of T.gondii was signifi cantly reduced in mice when the two genes were deletion.This study demonstrated that the pathogenicity of T.gondii decreased signifi cantly after the double-deletion of ROP5 and ROP18 genes,which provided a tool for exploring the synergistic effec
8、t between the two genes.Key words:Toxoplasma gondii;CRISPR/Cas9;gene knockout;ROP5 gene;ROP18 geneChinese Journal of Animal Infectious Diseases中国动物传染病学报2023,31(3):1-11 2 中国动物传染病学报2023 年 6 月刚地弓形虫(Toxoplasma gondii,T.gondii)为一种专性胞内寄生的顶复门原虫,可感染几乎所有温血动物的有核细胞1。全世界大约三分之一的人口感染了弓形虫2。流行病学调查显示,我国的弓形虫感染率为7.9%,
9、低于世界平均水平,但呈现逐年上升的趋势3。弓形虫主要有三种感染途径:经口感染,经血液感染及先天性感染4。当机体感染弓形虫后,通常表现为隐性感染,但免疫力低下者(如 艾滋病患者、恶性肿瘤患者、服用免疫抑制药物的患者等)感染弓形虫后会导致全身急性感染,严重时可导致死亡。此外,孕期感染弓形虫可导致流产、畸胎以及新生儿先天性弓形虫病等5。在畜牧业生产上,弓形虫可感染多种家畜,影响其生长发育与繁殖,并导致肉/奶产品质量下降,直接或间接带来巨大的经济损失,且食用被感染动物的肉制品或奶制品,也可将弓形虫传播给人类,严重威胁人类健康6。弓形虫危害严重与其具有逃逸宿主的天然免疫的功能相关7。棒状体蛋白(rhop
10、tries,ROPs)在入侵宿主过程中由弓形虫棒状体分泌,经虫体顶端释放至纳虫泡(parasitophorous vacuole,PV)或者宿主细胞胞质中,主要参与调节虫体入侵,增殖及PV形成等8。ROP18是 一种高度多态性的棒状蛋白激酶,具有丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶结构9,能特异性结合宿主细胞内的 免疫相关GTP酶(immunity-related GTPases,IRGs),主要磷酸化IRGs中的Irga6的第102位、108位苏氨酸,防止Irga6在纳虫泡膜上积累并破坏纳虫泡的完整性10。此外,ROP18还可以靶向 激活转录因子(activating transcription fact
11、or 6 beta,ATF6-),导致其降解,从而干扰ATF6-相关的免疫反应11,还可抑制宿主的NF-B信号通路12。近年来还发现弓形虫ROP18可通过线粒体凋亡途径抑制宿主细胞凋亡,维持线粒体膜电位和完整性,阻止细胞色素C从线粒体释放到细胞质中13-14。ROP5是由一组串联的、重复的高度多态性基因组成的假激酶15,与ROP18协同作用可增加ROP18的磷酸化活性16。此外,ROP5也可直接与纳虫泡膜(parasitophorous vacuole membrane,PVM)上的IRGs结合,当弓形虫缺乏ROP18基因时,ROP5在逃逸宿主免疫方面发挥重要作用17。此外,Zheng等18发
12、现ROP5的重组蛋白疫苗可 以诱导细胞和体液(Th1/Th2)免疫应答,延长感染RH株小鼠的存活时间。Yuan等19研究发现ROP18核酸疫苗可增强昆明鼠对弓形虫特异性Th1型应答,并显著延长小鼠的存活时间。上述表明ROP5、ROP18均为弓形虫重要的毒力因子,具有调节宿主天然免疫反应的 功能,可能还具有其他尚待发现的功能。本研究利用CRISPR/Cas9基因敲除技术构建弓形虫RH株ROP5的单基因缺失株,并在此基础上构建ROP5与ROP18的双基因缺失株,为进一步研究ROP5与ROP18的作用机制及基因缺失弱毒株疫苗奠定基础。1 材料与方法1.1 细胞、虫株、质粒与小鼠 Vero细胞由本实验
13、室液氮保存,复苏后培养于含10%胎牛血清的完全培养基;弓形虫RH株由本实验保存;弓形虫ROP18缺失株(ROP18-KO)由本实验前期试验构建并保存于液氮中;质粒pSAG1:CAS9:TgU6:sgUPRT与质粒pDHFR:UPRT-D为本实验室保存;pCas9-CAT质粒(Addgene,cat.no.80323)购自addgene;大肠杆菌TOP10感受态细胞购自天根生化科技(北京)有限公司;清洁级雌性昆明鼠购自上海杰思捷实验动物有限公司。1.2 主要试剂 DMEM培养基、PBS、胰酶均购自Gibco公司;胎牛血清 购自BI公司;基因组DNA提取试剂盒购自北京赛百盛基因技术有限公司;质粒提
14、取试剂盒购自天根生化科技(北京)有限公司;Phanta Max Super-Fidelity与ClonExpress MultiS One step Cloning Kit购自南京诺唯赞生物科技有限公司;结晶紫染色液购自碧云天生物技术公司;CFDA SE细胞增殖与示踪检测试剂盒购自碧云天生物技术公司。1.3 CRISPR/Cas9基因敲除质粒和同源重组质粒的构建及鉴定 根据NCBI在线数据库获取弓形虫RH株ROP5基因全长序列(GenBank:HQ916455.1),利用CRISPR/Cas9基因敲除系统在线网站(http:/crispr.mit.edu)设计ROP5的sgRNA引物,选取得分
15、 3 陈 芸等:弓形虫ROP5与ROP18的双基因缺失株构建及表型鉴定第 31 卷第 3 期较高的sgRNA序列,并将sgRNA引物送金唯智公司合成。以pSAG1:CAS9:TgU6:sgUPRT质粒为模板,将pSAG1:CAS9:TgU6:sgUPRT质粒以3个片段的形式扩增(引物见表1),并将质粒中的sgRNA序列替换为ROP5的sgRNA序列。对PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳及切胶回收纯化,再通过ClonExpress MuLtiS One step Cloning Kit进行连接。将同源重组后的产物转化至TOP10感受态细胞,再涂布于含有氨苄青霉素(Ampicillin,AMP)的固体培
16、养基上,筛选单克隆菌落,并进行菌液PCR鉴定,扩增产物送至擎科生物科技有限公司测序。以pUPRT:DHFR-D质粒为模板,扩增pROP5:DHFR-D质粒骨架部分及DHFR抗性基因部分,以RH株DNA为模板扩增ROP5的5UTR及3UTR片段,并通过ClonExpress MuLtiS Onestep Cloning Kit进行连接,构建pROP5:DHFR-D质粒(引物见表2),转化至TOP10感受态细胞,挑取单菌落进行菌液PCR鉴定,分别扩增5UTR与DHFR片段连接处,3UTR与DHFR片段连接处、验证质粒是否构建成功,引物见表3。以相同方法构建pROP18:CAT-D质粒,其中以pCa
17、s9/CAT质粒为模板,扩增氯霉素抗性基因(CAT)。表 1 构建 pSAG1:CAS9:TgU6:sgROP5 的引物Table 1 The primers for construction of pSAG1:CAS9:TgU6:sgROP5引物名称序列(5-3)用途NameSequence(5-3)PurposeTgRNA FgcttctcatgcccgctgcgtGTTTTAGAGCTAGAAATAGC扩增片段 1 和引入 gRNACAS Joint 1RAAAAGGCAACGGATGTAAAAG扩增片段 1CAS Joint 1FCTTTTACATCCGTTGCCTTTTCC扩增片段
18、2CAS Joint2 RGCCGTTTGTCTCGATCAGAGG扩增片段 2CAS Joint2 FCCTCTGATCGAGACAAACGGC扩增片段 3ROP5gRNARacgcagcgggcatgagaagcAACTTGACATCCCCATTTACCAG扩增片段 3 和引入 gRNA表 2 构建 pROP5:DHFR-D 的引物Table 2 The primers for construction of pROP5:DHFR-D引物名称序列(5-3)用途NameSequence(5-3)PurposeROP5 5KO-FACATCGAGGTGGACGTGGAAATATA扩增 ROP5
19、 5UTRROP5 5KO-RCTGGGAGATGTTGTGAGGTCTTGGT扩增 ROP5 5UTRROP5 3KO-FGAAAACGGCTCTGCCAACGGGGCGT扩增 ROP5 3UTRROP5 3KO-RGCTGCCTCTGTGGATCTCTCTAAAC扩增 ROP5 3UTRDHFR-FaccaagacctcacaacatctcccagAAGCTTCGCCAGGCTGTA扩增 DHFR 抗性基因DHFR-RacgccccgttggcagagccgttttcGGAATTCATCCTGCAAGTGC扩增 DHFR 抗性基因pROP5:DHFR-D-Fgtttagagagatccac
20、agaggcagcGTCGTACAGTTGACGTCGA扩增质粒骨架pROP5:DHFR-D-RtatatttccacgtccacctcgatgtGACAACTTTTCTATACAAAGTTGATAG扩增质粒骨架表 3 验证 pSAG1:CAS9:TgU6:sgROP5 与 pROP5:DHFR-D 的引物Table 3 The primers for identifi cation of pSAG1:CAS9:TgU6:sgROP5 and pROP5:DHFR-D引物名称序列(5-3)长度NameSequence(5-3)LengthPCR1 FAGCATCGCAGCACTGATGTTGG
21、CAT1113 bpPCR1 RGCAGTCAGATAACAGGTGTAGCGGCPCR2 FTGTCGTGCATCATGTATCAGCGGTC1470 bpPCR2 RCAACTGTGAAGCGGTGGAAC 4 中国动物传染病学报2023 年 6 月1.4 ROP5缺失株的构建及验证 收集新鲜逸出的RH株速殖子,经孔径为5 m的滤器过滤纯化后,用电转液Cytomix洗涤两遍并重悬虫体。将质粒pSAG1:CAS9:TgU6:sgROP5和pROP5:DHFR-D各30 g(11的比例)加入至1107个纯化后的弓形虫RH株中,再加入一定量的电转液,使最终体积为300 L,混匀后加入至2 mm间
22、距的电击杯中,用Gene Pulser Xcell电穿孔系统(Bio-rad伯乐)按照以下参数电转:电压为1500 V,电容为25 F,电阻为50。电转后的虫体转移至长满80%Vero细胞的6孔板中继续培养。培养48 h后,将培养基更换为含有3 mol/L息疟定的培养基,对弓形虫进行药物筛选,并将继续增殖的弓形虫转移至含80%Vero细胞的96孔板中进行单克隆筛选,连续筛选3代后,扩大培养单克隆虫株,并进行PCR验证,引物见表4。1.5 ROP5与ROP18双基因缺失株的构建及验证 将pSAG1:CAS9:TgU6:ROP18质粒和pROP18:CAT-D 质粒各30 g(11的比例)加入至1
23、107个纯化的ROP5-KO弓形虫悬液中,总体积为300 L,充分混匀后加入至间距为2 mm的电转杯,电转条件与参数同上,电转后继续放置于含Vero细胞的6孔板中培养,并用40 mol/L的氯霉素进行药物筛选,再在96孔板中进行3次亚克隆。筛选后的单克隆虫株在6孔板中继续扩大培养后,提取基因组DNA,扩增ROP5基因片段及ROP18基因片段,验证双基因缺失株是否构建成功(引物见表4)。表 4 用于鉴定 ROP5-KO 株和 ROP5/ROP18-KO 株的引物Table 4 The primers for identifi cation of ROP5-KO strain and ROP5/R
24、OP18-KO strain引物名称序列(5-3)长度NameSequence(5-3)LengthROP5 FCGGTGACCGATCTGTCGTATTTTTA901 bp(含 sgROP5)ROP5 RAGGTTGTCCTGTTGATAGGCTGCTCROP18 FTCGTCCGAATGGGTTTAG1628 bp(含 sgROP18)ROP18 R TTATTCTGTGTGGAGATGTTCCTGROP16 FCAGAGCGCTACAT TGGATTCAGGA876 bpROP16 RTACCACGGTTGCTT TGTTCTCAGG1.6 入侵试验 将RH株、ROP5-KO株、ROP1
25、8-KO株、ROP5/ROP18-KO株用CFDA SE标记(具体试验步骤见说明书),标记完成后,将各虫株加入至含90%Vero细胞的6孔板中,每孔接种1106个CFDA SE标记的弓形虫速殖子,37培养2 h后,PBS清洗未入侵Vero细胞的速殖子,继续培养12 h,细胞经胰酶消化后,用含10%FBS的DMEM完全培养基重悬,用Beckman Coulter Cytomics FC 500流式细胞仪检测弓形虫入侵Vero细胞的入侵率。1.7 弓形虫增殖试验 将每种虫株(各5105个速殖子)分别接种于含Vero细胞的6孔板中,每个虫株设3个重复孔。37培养12 h 后,PBS清洗除去未入侵细胞
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