1例无创产前检测提示13-三体综合征与21-三体综合征同时高风险胎儿的产前诊断.pdf
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1、 604D0I:10.13602/ki.jcls.2023.08.101例无创产前检测提示13-三体综合征与2 1-三体综合征同时高风险胎儿的产前诊断临床检验杂志2 0 2 3年8 月第41卷第8 期月Chin J Clin Lab Sci,Aug.2023,Vol.41,No.8临床实验研究张颖,王皖骏,段红蕾,李洁(南京大学医学院附属鼓楼医院产前诊断中心,南京2 10 0 0 8)摘要:目的明确无创DNA产前检测发现1例13-三体综合征与2 1-三体综合征同时高风险的胎儿的遗传学病因。方法对一例普通无创产前检测提示13-三体综合征与2 1-三体综合征并存高风险的胎儿后续进行扩展性无创产前检
2、测,羊水染色体微阵列检查与父母外周血染色体核型检查。结果普通无创DNA产前检测胎儿游离DNA浓度为19.5%,提示胎儿2 1号和13号染色体同时存在重复高风险;扩展性无创产前检测胎儿游离DNA浓度为18.5%,提示胎儿2 1号和13号染色体同时存在染色体片段重复;羊水染色体微阵列结果为arrG RCh 38 13q 14.3q 34(50 6 46 8 48-114342 2 58)36 3.7 M b,a r r G RCh 38 21q11.2q21.3(136 4416 6-2 6 0 357 7 1)312.4M b;胎儿父亲外周血染色体检查为46,XY,母亲为46,t(13,21)(
3、q 14.3,q 11.2)。结论对于无创产前检测检出特殊结果的样本,扩展性无创产前检测能够提高测序数据量和优化算法,可为临床提供更多有用信息,但最终还需要通过产前诊断验证结果;家系追溯有助于明确遗传学病因,有利于后续遗传咨询。关键词:扩展性无创产前检测;产前诊断;高风险中图分类号:R446无创产前检测(noninvasive prenatal testing,NIPT)是通过提取孕妇外周血中胎儿游离DNA,对其进行测序及生物信息学分析,最终实现对胎儿染色体非整倍体患病风险进行评估1-2 。NIPT因其敏感性高、特异性高、无创等优点已在临床上广泛应用。近年随着测序深度的增加及生物信息学算法的优
4、化,NIPT不仅实现了对胎儿常见染色体非整倍体(2 1、18 和13号染色体)的筛查,还被扩展到其他染色体非整倍体及染色体微缺失/重复综合征(microdeletion/microduplication syndrome,MMS)的筛查 3,即扩展性NIPT。本研究对1例无创产前检测提示13-三体综合征、2 1-三体综合征同时高风险的孕妇进行产前诊断及家系分析,为临床遗传咨询提供参考。1对象与方法1.1研究对象孕妇,2 3岁,孕1产0,自然妊娠孕17周,单胎,早孕超声显示胎儿颈项透明层厚度(nuchal translucency,NT)2.4 mm。孕妇门诊自愿要求进行NIPT以评估胎儿常见染
5、色体病患病风险,并签署知情同意书。NIPT报告提示13-三体综合征、2 1-三体综合征同时高风险,经遗传门诊咨询后,行羊水穿刺进行胎儿染色体微阵列分析,孕妇作者简介:张颖,198 3年生,女,副主任技师,硕士,主要从事产前筛查及产前诊断方向。通信作者:李洁,主任医师,E-mail;。文献标志码:A及其丈夫同时采集外周血进行染色体核型分析。本研究通过南京鼓楼医院伦理委员会批准(批准文号:2 0 2 2-12 0-0 2)。1.2主要仪器与试剂高速冷冻离心机(美国ThermoFisher公司),Qubit2.0核酸定量仪(美国ThermoFisher Scientific公司),荧光定量PCR仪(
6、美国ABISTEPONEPLUS公司),NextSeqCN500基因测序仪(美国Illumina公司),分析软件为ChAS4.0GLS-120全自动染色体核型分析系统(德国Leica公司),GEVolusonE10彩色多普勒超声诊断仪(美国GE公司),配备腹部凸阵探头(3 5MHz)。血浆游离DNA提取试剂盒,胎儿染色体非整倍体检测试剂盒,测序反应通用试剂盒均购自杭州贝瑞公司。CMA芯片AITymetrixCytoScan750K(美国ThermoFisher公司),外周血染色体培养基、羊水染色体培养基(广州白云山公司)。1.3方法1.3.1NIPT及扩展性NIPT使用EDTA-K,抗凝管采集
7、孕妇外周血10 mL,4h内冷冻离心机16 0 0r/min10min、普通离心16 0 0 0 r/min 10 min后分离血浆,保存于-2 0 。提取血浆游离 DNA,并且对提取的血浆游离 DNA 浓度进行检测。文库构建和纯化后,利用荧光定量PCR仪进行文库定量。采临床检验杂志2 0 2 3年8 月第41卷第8 期用基础性、扩展性NIPT样本混合上机测序方式,扩展性NIPT样本的DNA文库上机量为普通NIPT的5倍。使用NextSeqCN500测序仪及配套试剂盒进行DNA测序 41.3.2羊水染色体微阵列分析(chromosomalmi-croarray analysis,CM A)知情
8、同意后,由妇产科医生于孕17 周在超声引导下行羊膜腔穿刺术,采集羊水10 mL。基因组DNA提取、CMA实验及分析、验证流程按本中心常规操作流程进行 5。拷贝数变异(copynumbervariariations,CNVs)的性质主要依据ClinGen2019年颁布的指南,报告原则为:(1)在具有重要临床意义的区域,DNA拷贝缺失 10 0 kb;(2)在已知具有重要临床意义的区域外,连续DNA拷贝缺失达50 0 kb以上或连续拷贝重复达1Mb以上(在这些区域内的探针密度达到每10 0 kb具有2 0 个以上探针,同时存在1个在线人类孟德尔遗传基因)。1.3.3外周血染色体核型分析使用肝素钠抗
9、凝管采集外周血3mL,采用常规方法细胞培养、收获、制片、G显带,染色体分辨率为450 550 条带,每份标本计数2 0 50 个中期分裂相,分析3 5个核型,按人类染色体国际命名系统(ISCN2016)描述核型。1.3.4NIPT 质量控制管理及结果判断判断标准 6 420-24220-202.2胎儿羊水染色体微阵列结果羊水染色体微阵列结果提示13号染色体和2 1号染色体重复,具体为 13q14.2q34(50 6 46 8 48-114342 2 58)36 3.7 M b,21q11.2q21.3(13644166-26035771)312.4 Mb,结果和NIPT及扩展性 NIPT结果显
10、示一致。月Chin J Clin Lab Sci,Aug.2023,Vol.41,No.8112912O10P3P12P112:605.胎儿游离DNA比例 3%,下机数据Q3085%,36.5%GC%1.5 Mb,扩展性 NIPT单个样本唯一比对序列数据量 10 Mb,为质控合格。Z3为重复或三体型高风险,Z 2.4判断为母源性重复,拷贝数 1.6 判断为母源性缺失。2结果2.1NIPT结果胎儿游离DNA浓度(cell-free fe-talDNA,fDNA)19.5%,有效数据量为2.4Mb,室内质控Q30显示9 3.8%,GC含量为40.0 7%,结果提示13-三体综合征和2 1-三体综合
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