基于生物信息学分析IGF2BP基因家族在肝癌中的预后价值及中药靶向治疗的研究.pdf
《基于生物信息学分析IGF2BP基因家族在肝癌中的预后价值及中药靶向治疗的研究.pdf》由会员分享,可在线阅读,更多相关《基于生物信息学分析IGF2BP基因家族在肝癌中的预后价值及中药靶向治疗的研究.pdf(7页珍藏版)》请在咨信网上搜索。
1、通讯作者:.基于生物信息学分析 基因家族在肝癌中的预后价值及中药靶向治疗的研究周金爱陈源红杨建波(右江民族医学院基础医学院广西百色)摘要 目的 研究胰岛素样生长因子 结合蛋白()家族在人类肝癌中的表达和预后价值 方法通过 数据库分析 基因家族在肝癌中的表达水平 采用 数据库评估 基因家族的表达与肝癌患者预后的相关性使用 数据库探索 家族在 肝癌患者组织中共表达基因情况通过 数据库对差异基因进行 通路富集分析通过 数据库分析 家族的表达与甲基化相关性并基于 数据库分析 基因家族与各种肿瘤浸润免疫细胞的相关性 结果 基因家族在肝癌组织中呈高表达、和 的高表达与肝癌患者总生存率显著相关 与 和 表达
2、存在互作的差异性基因有、与 表达关联紧密的基因有、等 它们主要富集在代谢途径、视黄醇新陈代谢、咖啡因代谢、药物代谢细胞色素、细胞周期、化学致癌作用、复制等通路 在肝癌中 家族的高表达与甲基化相关 基因家族的表达与 种肿瘤免疫细胞变化相关 结论 家族的表达与预后、甲基化密切相关其可能通过影响免疫细胞的浸润相关通路调控肝癌的发生与发展有望作为肝癌的潜在治疗靶标关键词 肝癌 基因家族预后生物信息学中药中图分类号.文献标识码 文章编号 ():./.()()().蛇 志 ()年第 卷第 期.肝细胞癌(简称肝癌)是世界上最常见的恶性肿瘤之一 根据 年以来的癌症统计数据肝癌的死亡率在所有癌症中排名第 位 目
3、前甲胎蛋白()是肝癌的主要诊断和预后标志物但其对早期肝癌的诊断灵敏度和特异度性较差 因此迫切需要寻找新的生物标志物作为肝癌的潜在诊断指标和治疗靶点 胰岛素样生长因子结合蛋白()又 称 结 合 蛋 白()包括()、()和()其中 在胚胎发生和致癌作用中起着重要作用 研究表明 可以通过增强肿瘤细胞的增殖和转移来达到致癌的目的 有研究发现 在肝癌组织中呈高表达其通过直接识别并结合 的 位点增强了 的稳定性促进肝癌细胞增殖 而关于 与肝癌的关系研究较少目前关于 基因家族在肝癌发生发展中的表达、功能、机制尚未清楚 因此本研究利用生物信息学方法对肝癌数据进行更深入的研究为肝癌的研究提供科学依据 材料与方法
4、.数据来源通过(:/./.)数据库分析 基因家族在肝癌和正常肝组织中的表达差异包括 例肝癌组织样品和 例正常对照组织样品以 .为差异具有统计学意义.基因家族的表达与肝癌患者预后相关性分析通过 数据库评估 基因家族的表达水平与肝癌患者总生存期的相关性以 .为差异具有统计学意义.基因家族共表达基因的筛选和通路富集分析本研究使用(:/.)数据库探索 家族在 数据库肝癌患者组织中共表达基因情况并通过 网站上的在线基因功能注释工具(版本.)(:/./.)对差异基因进行 通路富集分析以.为入选的标准.基因家族的表达与甲基化关系 通过(:/./)数据库分析 家族 组肝癌样品共 例肝癌患者的基因组水平变化.基
5、因家族与肿瘤免疫细胞浸润的关系在(:/./)数据库的 模块输入 基因家族分析该家族与 细胞、细胞、细胞、单核细胞、中性粒细胞和树突状细胞等各种肿瘤浸润免疫细胞的相关性通过 检验分析数据.为差异具有统计学意义.治疗肝癌药物的筛选方法将 基因家族在肝癌中共表达 基因导入(:/./)数据库在 模块通过设置条件 .筛选用于治疗肝癌的中药 通过(:/./.)数据库、(:/./)数据库寻找中药有效成分并利用 软件构建中药成分核心靶点网络图 结果.家族在肝癌组织中的表达 为进一步研究 基因家族在肝癌组织中的表达通过 数据库分析 基因家族在 数据库来源的 例肝癌组织以及 例正常组织中的表达 结果显示、和 表达
6、水平在肝癌组织中比正常组织升高差异具有统计学意义(.)见图.家族表达与肝癌患者预后的关系分析 为研究 基因家族表达量与肿瘤患者总生存率之间的关系对 中的肝癌数据进行分析结果显示在肝癌患者中 的高表达与肝癌患者总生存率显著相关差异具有统计学意义(.)和 的高表达与肝癌患者的总生存率有相关性差异均有统计学意义(.)见图.家族在肝癌中的共表达基因筛选以及功能富集分析 基于 数据库分析 基因家族在肝癌中共表达基因 通过热图展示与肝癌最紧密关联的 基因 其中与 和 表达关联紧密的基因有、与 表达 关 联 紧 密 的 基 因 有、等 见 图 将 差 异显著 的 基 因 通 过 数 据 库 进 行 分析 结
7、 果 显 示 分 析 主 要 富 集 在代谢途径、视黄醇新陈代谢、咖啡因代谢、药物代谢细胞色素、细胞周期、化学致癌作用、复制等通路见图 蛇 志 ()年第 卷第 期.图 基因家族在 中肝癌组织的表达注:在肝癌组织的表达:在肝癌组织的表达:在肝癌组织的表达 与正常组织比较.图 家族表达与肝癌患者生存关系注:表达与肝癌患者总生存率之间的关系:表达与肝癌患者总生存率之间的关系:表达与肝癌患者总生存率之间的关系图 家族在肝癌中差异性共表达 基因 注:在肝癌中差异性共表达 基因:在肝癌中差异性共表达 基因:在肝癌中差异性共表达 基因.家族的表达与甲基化关系通过 数据库分析 家族的基因组水平变化结果显示在选
8、取的 组肝癌研究中包括 例肝癌样本、和 的表达与甲 基 化 呈 负 相 关 差 异 均 具 有 统 计 学 意 义(.)见图 蛇 志 ()年第 卷第 期.图 家族差异性共表达基因的 分析注:差异性共表达基因的 分析:差异性共表达基因的 分析:差异性共表达基因的 分析图 家族的表达与甲基化的关系注:的表达与甲基化的关系:的表达与甲基化的关系:的表达与甲基化的关系.家族的表达与免疫细胞浸润关系 通过 数据库分析发现 基因家族成员与各类免疫浸润细胞的相关性是高度一致的即 肝癌中 表达水平与 细胞、细胞、细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突细胞浸润水平均呈显著正相关(.)见图.潜在中药预测将 基因家族在肝
9、癌中共表达 基因导入 数据库查找对应中药的名称经过整理共有 种中药其中红花和枸橼(香橼)出现的频次为 次见表 在 数据库和 数据库中寻找中药有效成分删除两个数据库有效成分不同的中药通过 制作中药有效成分核心基因网络图正六边形为核心基因其余为中药有效成分形成以 为核心基因网络图通过 方法计算 为 谷甾醇、亚麻子、芍药新苷、芍药苷、儿茶素、肋麦角碱、吡咯利西啶生物碱、多梗白菜菊素、豆甾醇 见图 讨论目前临床上对早期肝癌患者可通过手术治疗联合辅助治疗达到预后良好的效果但大多数患者一经发现已是肝癌晚期不能单独进行手术切除即使通过手术切除后肝癌的 年复发率仍较高因此探索有效的生物标志物有利于肝癌的早期发
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 基于 生物 信息学 分析 IGF2BP 基因 家族 肝癌 中的 预后 价值 中药 靶向 治疗 研究
1、咨信平台为文档C2C交易模式,即用户上传的文档直接被用户下载,收益归上传人(含作者)所有;本站仅是提供信息存储空间和展示预览,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对上载内容不做任何修改或编辑。所展示的作品文档包括内容和图片全部来源于网络用户和作者上传投稿,我们不确定上传用户享有完全著作权,根据《信息网络传播权保护条例》,如果侵犯了您的版权、权益或隐私,请联系我们,核实后会尽快下架及时删除,并可随时和客服了解处理情况,尊重保护知识产权我们共同努力。
2、文档的总页数、文档格式和文档大小以系统显示为准(内容中显示的页数不一定正确),网站客服只以系统显示的页数、文件格式、文档大小作为仲裁依据,平台无法对文档的真实性、完整性、权威性、准确性、专业性及其观点立场做任何保证或承诺,下载前须认真查看,确认无误后再购买,务必慎重购买;若有违法违纪将进行移交司法处理,若涉侵权平台将进行基本处罚并下架。
3、本站所有内容均由用户上传,付费前请自行鉴别,如您付费,意味着您已接受本站规则且自行承担风险,本站不进行额外附加服务,虚拟产品一经售出概不退款(未进行购买下载可退充值款),文档一经付费(服务费)、不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
4、如你看到网页展示的文档有www.zixin.com.cn水印,是因预览和防盗链等技术需要对页面进行转换压缩成图而已,我们并不对上传的文档进行任何编辑或修改,文档下载后都不会有水印标识(原文档上传前个别存留的除外),下载后原文更清晰;试题试卷类文档,如果标题没有明确说明有答案则都视为没有答案,请知晓;PPT和DOC文档可被视为“模板”,允许上传人保留章节、目录结构的情况下删减部份的内容;PDF文档不管是原文档转换或图片扫描而得,本站不作要求视为允许,下载前自行私信或留言给上传者【自信****多点】。
5、本文档所展示的图片、画像、字体、音乐的版权可能需版权方额外授权,请谨慎使用;网站提供的党政主题相关内容(国旗、国徽、党徽--等)目的在于配合国家政策宣传,仅限个人学习分享使用,禁止用于任何广告和商用目的。
6、文档遇到问题,请及时私信或留言给本站上传会员【自信****多点】,需本站解决可联系【 微信客服】、【 QQ客服】,若有其他问题请点击或扫码反馈【 服务填表】;文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“【 版权申诉】”(推荐),意见反馈和侵权处理邮箱:1219186828@qq.com;也可以拔打客服电话:4008-655-100;投诉/维权电话:4009-655-100。