三疣梭子蟹PtToll6基因克隆及其在免疫中的功能研究.pdf
《三疣梭子蟹PtToll6基因克隆及其在免疫中的功能研究.pdf》由会员分享,可在线阅读,更多相关《三疣梭子蟹PtToll6基因克隆及其在免疫中的功能研究.pdf(10页珍藏版)》请在咨信网上搜索。
1、第 54 卷 第 4 期 海 洋 与 湖 沼 Vol.54,No.4 2 0 2 3 年7 月 OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA Jul.,2023 *国家虾蟹产业技术体系,CARS-48 号;国家自然科学基金项目,42076116 号;中国水产科学研究院基本科研业务费,2020TD46 号。张伟伟,硕士研究生,E-mail: 通信作者:刘 萍,研究员,E-mail: 收稿日期:2022-11-01,收修改稿日期:2023-01-14 三疣梭子蟹 PtToll6 基因克隆及其在免疫中的功能研究*张伟伟1,2 吕建建2 李玉坤1,2 初凡智1,2 高保全2 刘 萍
2、2(1.上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心 上海 201306;2.中国水产科学研究院黄海水产研究所 海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室 山东青岛 266071)摘要 克隆了三疣梭子蟹TLR家族的一个新基因,将其命名为PtToll6。该基因全长为4 034 bp,预测分子量为 109.078 kDa,理论等电点为 6.06,共编码 977 个氨基酸。SMART 预测显示,PtToll6 具有Toll 样受体典型的结构域,包括前端的序列区(LRR)、跨膜区(TM)和胞内(TIR)区,进化树分析表明其与同属节肢动物门的果蝇 Dm toll9 聚为一支。组织表达分布结果显示,PtT
3、oll6 在肝胰腺中特异性地高表达,其次表达于肠道,在鳃中的表达量最低。采用 3 种 PAMPs 进行注射刺激,发现 PtToll6 对脂多糖的响应最为强烈,在感染 48 h 后的表达量为对照组的上千倍,推测其可能为 PtToll6 基因主要识别的病原相关分子模式。PtToll6 在人工感染副溶血弧菌后的 12 h 开始上调表达,至 24 h 达到峰值(上调 9.02 倍)。采用 RNAi 敲降 PtToll6 后,MyD88 的表达量相应下调,同时发现感染副溶血弧菌后的死亡率显著提高,为阴性对照组的 1.8 倍。实验结果表明:PtToll6 基因在抗副溶血弧菌中发挥重要功能。本实验对解析三疣
4、梭子蟹抵御病原入侵的分子机制具有重要指导作用。关键词 三疣梭子蟹;Toll 样受体;模式识别受体;病原相关分子模式 中图分类号 S917 doi:10.11693/hyhz20221100285 三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)隶属于甲壳纲(Crustacea)、十 足 目(Decapoda)、梭 子 蟹 科(Portunidae)、梭子蟹属(Portunus),地理分布集中在我国渤海、黄海,以及日本等海域,肉多且脂膏肥美,具有十分重要的经济价值(戴爱云等,1977;薛俊增等,1997)。随着人工养殖的规模逐渐扩大,苗种参差不齐,导致病害严重,给养殖业带来了巨大的
5、经济损失。副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)是三疣梭子蟹主要的致病菌之一,可以诱导肝胰腺坏死病等多种病症,该病原可引发梭子蟹生长缓慢、嗜睡、空腹、空肠,最终致其死亡(郝景伟等,2019;霍诗天等,2022)。与哺乳类动物不同的是,三疣梭子蟹没有 B 淋巴细胞和 T淋巴细胞,缺少获得性免疫系统。在应对病原入侵时,只能依赖于与生俱来的先天性免疫系统,通过免疫信号通路级联反应来实现识别清除病原的作用(Uematsu et al,2008)。因此,研究其先天性免疫机理对三疣梭子蟹抗病以及新品种培育有着重要意义。Toll 样受体(Toll-like receptor,TLR)等
6、模式识别受体(Pathogen recognize receptor,PRR)能够在病原刺激中介导三疣梭子蟹等甲壳动物的先天免疫,各类PRR 都能通过识别病原中某种保守的病原相关分子模式(Pathogen associated molecular pattern,PAMPs),启动先天性免疫应答(Carty et al,2010)。TLR 家族基因具有高度的保守性,在漫长的生物进化历程中末端的 TIR 结构域都高度同源,且 Toll 蛋白均属于型跨膜结构蛋白。其结构包括胞外在免疫中起到关键识别作用的序列区(LRR)、跨膜区(TM)和与白介素受体高度同源的胞内区(TIR)(Slack et al
7、,2000;章晓联等,4 期 张伟伟等:三疣梭子蟹 PtToll6 基因克隆及其在免疫中的功能研究 1173 2002;Uribe et al,2011)。TLR 家族下信号通路主要有两种依赖途径,一条是 MyD88(髓样分化因子 88)依赖途径,另一条是非依赖 MyD88 途径,通过 TRIF 进行信号转导,MyD88 与 TRIF 都属于 TLR 的下游接头分子(Yamamoto et al,2002;Tang et al,2012)。目前在甲壳动物中,TLRs 家族基因都只进行了一些基础性的研究,如 Yang 等(2007)在凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)中发现了
8、一个 Toll 样受体,命名为 LvToll,这是在甲壳动物中发现的首个 TLR 家族基因。另外,在三疣梭子蟹中已克隆了 5 个 TLR 基因并初步分析其在病原胁迫后的表达模式(Zhou et al,2015;张杰,2017)。然而,相比哺乳类(王有琴等,2021;章琳俐等,2021)和昆虫类(Yagi et al,2010),甲壳动物 TLR 基因的研究基础相对薄弱,主要体现在:(1)尚不明确其识别的 PAMPs,(2)缺乏必要的功能验证研究,(3)对其分子调控通路解析不足。本实验克隆了三疣梭子蟹 PtToll6 基因,分析了该基因的组织表达分布特征,明确了其主要识别的PAMPs。初步验证了
9、 PtToll6 基因在抗副溶血弧菌感染中具有一定作用,可能依赖 MyD88 途径发挥免疫功能。研究结果为深入解析甲壳动物 TLR 基因的功能提供依据,同时可为三疣梭子蟹抗病良种培育提供一定参考。1 材料与方法 1.1 实验样品的采集 实验所用的三疣梭子蟹取自于山东省昌邑市海丰水产公司。在饲养至 80 日龄时,选取健康有活力的三疣梭子蟹体重为(305)g,将其置于一个 20 m3的混凝土池塘中暂养 7 d,用于后续实验。实验条件保持昼夜水温(253)C,盐度 35,pH 8.7。每天对水体进行换水,换水量为 1/3,并定时喂食新鲜杂鱼,实验全程于此公司实验车间进行。在室内水泥池暂养 7 d 后
10、,随机选取 9 只暂养的健康三疣梭子蟹,分别采集心脏、表皮、胃、肠、脑、肝胰腺、鳃、眼柄、血淋巴、肌肉共 10 个不同的组织,置于液氮中保存,用于合成 RACE 模板和 PtToll6的组织表达分析。1.2 实验方法 1.2.1 总RNA提取、cDNA和RACE模板合成 取上述三疣梭子蟹 10 个不同的组织各 50 mg,按照TRIzol Reagent(Roche 公司)方法进行总 RNA 提取,并利用紫外分光光度计(NanoDrop2000,Thermo)和 1%琼脂糖凝胶电泳检测提取的总 RNA 的质量和浓度。选取不同组织高质量的RNA,使用HiScript II Q RT Super
11、Mixfor qPCR(+gDNA wiper)kit(诺维赞,南京)合成cDNA。将各组织中高质量的总RNA均匀混合,使用SMARTer RACE cDNA Amplification Kit(TaKaRa,日本)合成3和5 RACE cDNA模板。1.2.2 三疣梭子蟹 Pt-Toll6 的 cDNA 全长的克隆、序列及进化分析 根据从本实验室构建的三疣梭子蟹基因组数据库中筛选验证得到的 PtToll6 基因 EST序列,利用 PrimerPremier5.0 软件设计 PtToll6 的 3和 5 RACE 特异性引物及通用引物并由上海生工生物工程有限公司合成(表 1)。使用 Trans
12、Taq DNA Polymerase High Fidelity(HiFi)高保真聚合酶(全式金生物,北京)参照说明书进行 RACE 3和 5末端巢式PCR 扩增,将 PCR 产物回收纯化并进行连接转化,挑取单克隆,经菌落 PCR 鉴定后筛选目的菌液送至上海生工生物工程有限公司进行测序,参照宋柳等(2019)。通过ContigExpress软件将克隆序列与EST序列进行拼接、验证,得到PtToll6基因的 cDNA全长,分别 采 用 NCBI-BLAST(https:/blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)、ORFFinder(https:/www.ncbi.nlm
13、.nih.gov/orffinder/)在线网站对序列进行比对分析及开放阅读框(ORF)的预测。蛋白质功能结构域利用SMART(http:/smart.emblheidelberg.de/)网站进行预测。利用DNAMAN软件将PtToll6与甲壳动物中的TLR基因进行蛋白质序列比对,并通过MEGA软件对PtToll6进行构建系统进化树分析。1.2.3 三疣梭子蟹 PtToll6 的组织表达分析 将不同个体相同组织的 cDNA等浓度混合,用于组织表达分析。根据已获得的 PtToll6 cDNA 全长序列,通过PrimerPremier5.0 软件设计实时荧光定量 PCR 特异性引物,内参基因选用
14、-actin(表 1),具体 PCR 实验体系及方法参考宋柳等(2019)。使用 SPSS19.0 软件对实验过程中产生的数据进行单因素方差分析,借助OriginPro 将统计结果整理形成图表,P0.05 为显著差异,P0.01 为极显著性差异。1.2.4 病原相关分子模式刺激 随机选择 120 只经过室内暂养后大小一致、健康有活力的三疣梭子蟹,平均分成 4 组,各组分别注射 1PBS 缓冲液 100 L、1 mg/mL 脂多糖 100 L、1 mg/mL 肽聚糖 100 L 以及 1 mg/mL Poly IC 100 L。在注射后 0、12、24、48、72 h,每组分别随机选取 3 只三
15、疣梭子蟹,取肝胰腺组织置于液氮中保存,用于 RNA 提取。1174 海 洋 与 湖 沼 54卷 表 1 实验所用的引物序列 Tab.1 The sequence of primers used in the experiment 引物 序列 用途 PtToll6-5R1 ACTTGTATGCCTGACACGGGTTC 5RACE PtToll6-5R2 CTGCAATGCGACAGTACATAAGGT 5RACE PtToll6-3F1 AGGACGCCGACCACTACCTGTACGA 3RACE PtToll6-3F2 CATCAACTCAGTAGATCGCTCCA 3RACE-actin
16、-F CGAAACCTTCAACACTCCCG qRT-PCR 内参-actin-R GGGACAGTGTGTGAAACGCC qRT-PCR 内参 PtToll6-F5 GTAATCCGTTCGTGTGCGAC 荧光定量引物 PtToll6-R5 CCGAGTAGCACTTGATGTCCT 荧光定量引物 1.2.5 副溶血弧菌感染 随机将 60 只室内暂养后大小一致、健康有活力的三疣梭子蟹,平均分成 2 组(攻毒组和对照组)进行预实验。对照组为注射无菌的海洋甲壳动物生理盐水,攻毒组为注射副溶血弧菌,浓度依据张杰等(2017)报道注射副溶血弧菌的浓度(2.6107 CFU/mL)进行预实验。剂
17、量均为 1 L/g(体重)。在自然海水以及最适温度下,72 h 半致死,而对照组没有死亡情况出现,此剂量浓度作为正式实验使用。选取 180 只三疣梭子蟹进行正式实验,平均分为两组即实验组与对照组,在梭子蟹游泳足的第一关节基部处进行注射(谢建军等,2011;Ren et al,2017)。实验组注射 2.6107 CFU/mL 的副溶血弧菌,对照组注射海洋甲壳动物生理盐水,剂量均为 1 L/g。副溶血弧菌悬液参照窦全伟等(2018)的方法提取制备。分别在注射后 0、12、24、48、72 h,每组各随机取 3只三疣梭子蟹的肝胰腺组织于液氮中保存,用于RNA 提取。1.2.6 PtToll6 基因
18、 RNAi 实验 本实验通过生工生物工程(上海)股份有限公司设计的干扰序列进行位点筛选,最后确定具有干扰效果的一对序列由公司合成(表 2)。RNAi 实验共分为 4 组各 60 个个体:实验组(注射 PtToll6 siRNA)、阴性对照组(注射 NC siRNA)、空白对照组(注射生理盐水)、阳性对照组(注射生理盐水)。将 siRNA 浓度稀释为 1 g/L,阴性对照组和实验组根据三疣梭子蟹个体的体重进行注射(注射量为1 g/g);空白对照组和阳性对照组根据三疣梭子蟹个体的体重进行注射生理盐水(注射量为 1 L/g)。在注射后 0、24、48、72 h,分别取空白对照组、阴性对照组和实验组
19、3 只三疣梭子蟹的肝胰腺组织于液氮中保存,用于干扰效率检测。在 RNAi 实验 24 h 后,4 组各取 30 个个体进行攻毒实验,按体重注射(注射量为 1 L/g):空白对照组注射 1PBS 缓冲液;其他 3 个组注射 2.6107 CFU/mL副溶血弧菌。实验每 3 h 统计一次死亡数。在 0、12、24、48、72 h,每组分别选取 3 只依然存活的三疣梭子蟹解剖取肝胰腺组织存于液氮中保存。1.2.7 接头分子的实时荧光定量分析 利用材料1.2.2 方法,得到了 MyD88 与 TRIF 的 cDNA 序列,并设计了 qRT-PCR 引物,所用引物如表 3,使用 1.2.6中 PtTol
20、l6 RNAi 材料,对其下游接头分子进行实时荧光定量分析。表 2 本研究所用双链 RNA Tab.2 The double-stranded RNA used in the experiment 双链 RNA 序列(53)PtToll6 GCA ACU CGC UCA UCA CCA UTT AUG GUG AUG AGC GAG UUG CTT NC UUC UCC GAA CGU GUC ACG UTT ACG UGA CAC GUU CGG AGA ATT 表 3 实验所用的引物序列 Tab.3 The sequence of primers used in the experimen
21、t 引物 序列 用途-actin-FCGAAACCTTCAACACTCCCG qRT-PCR 内参-actin-RGGGACAGTGTGTGAAACGCC qRT-PCR 内参MyD88-F1CAGATGAGAAAGACCCCGTT 荧光定量引物MyD88-R1ATTCCCCAGAAGTGGACGAC 荧光定量引物TRIF-F1TCTGCCTACGACTGAACCTAA 荧光定量引物TRIF-R1CCAGTAAGGCAAAGGTGATGAC 荧光定量引物 2 结果与分析 2.1 PtToll6 基因 cDNA 全长及序列结构特征 PtToll6 的 cDNA 全长为 4 034 bp,其中包括
22、129 bp 的 5 UTR,2 934 bp 的 ORF 区域,和 1 100 bp的 3 UTR,预测分子量为 109.078 kDa,理论等电点为 6.06,共编码 977 个氨基酸(图 1)。利用 SMART 在线预测分析网站以及 DNAMAN 软件对 PtToll6 进行 4 期 张伟伟等:三疣梭子蟹 PtToll6 基因克隆及其在免疫中的功能研究 1175 图 1 PtToll6 基因 cDNA 全长及氨基酸序列 Fig.1 Full-length cDNA and amino acid sequence of PtToll6 gene 1176 海 洋 与 湖 沼 54卷 蛋白结
23、构、序列比对分析。结果显示,PtToll6 具有 Toll样受体蛋白的重要结构域:LRR、TIR(图 2),且 PtToll6与其他甲壳动物Toll具有高度同源的TIR保守区,而胞外的 LRR 较为复杂多样(图 3)。三疣梭子蟹 PtToll6 与其他 Toll 的序列同源性较低,同源性为 8.42%17.92%,其中同源性最高的是克氏原螯虾(Procambarus clarkii),同源性为 17.92%。利用 MEGA 5.0 软件对 PtToll6 基因进行系统进化分析,图 4 结果显示,PtToll6 没有与亲缘关系近的甲壳动物聚在一起,反而是与同属节肢动物门的果蝇Dm Toll 9单
24、独聚为一支(PtToll6以红色圆点表示)。在已发表的三疣梭子蟹中,有两个分别与亲缘关系较近的中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)EsToll2、拟穴青蟹(Scylla paramamosain)SpToll 聚在一起,而其他三疣梭子蟹 Toll 都是与果蝇 Toll 聚在一起(已发表的三疣梭子蟹 Toll 以红色圆圈表示)。2.2 PtToll6 的组织表达分布 利用实时荧光定量 PCR 技术,分析了 PtToll6 在不同组织中的相对表达情况。如图 5 所示,PtToll6 在心脏、表皮、胃、肠、脑、肝胰腺、鳃、眼柄、血淋巴、肌肉这 10 个组织中均有表达。其中,PtToll
25、6 在肝胰腺中特异性地高表达,其次在肠以及脑中的表达量相对较高,在鳃组织中的表达量最低。图 2 PtToll6 基因编码蛋白结构域位置 Fig.2 The location of the protein domain encoded by the PtToll6 gene 图 3 PtToll6 氨基酸序列的多序列比对 Fig.3 Multiple sequence alignment of the PtToll6 amino acid sequence 4 期 张伟伟等:三疣梭子蟹 PtToll6 基因克隆及其在免疫中的功能研究 1177 图 4 PtToll6 的系统进化树 Fig.4 P
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 梭子蟹 PtToll6 基因 克隆 及其 免疫 中的 功能 研究
1、咨信平台为文档C2C交易模式,即用户上传的文档直接被用户下载,收益归上传人(含作者)所有;本站仅是提供信息存储空间和展示预览,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对上载内容不做任何修改或编辑。所展示的作品文档包括内容和图片全部来源于网络用户和作者上传投稿,我们不确定上传用户享有完全著作权,根据《信息网络传播权保护条例》,如果侵犯了您的版权、权益或隐私,请联系我们,核实后会尽快下架及时删除,并可随时和客服了解处理情况,尊重保护知识产权我们共同努力。
2、文档的总页数、文档格式和文档大小以系统显示为准(内容中显示的页数不一定正确),网站客服只以系统显示的页数、文件格式、文档大小作为仲裁依据,平台无法对文档的真实性、完整性、权威性、准确性、专业性及其观点立场做任何保证或承诺,下载前须认真查看,确认无误后再购买,务必慎重购买;若有违法违纪将进行移交司法处理,若涉侵权平台将进行基本处罚并下架。
3、本站所有内容均由用户上传,付费前请自行鉴别,如您付费,意味着您已接受本站规则且自行承担风险,本站不进行额外附加服务,虚拟产品一经售出概不退款(未进行购买下载可退充值款),文档一经付费(服务费)、不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
4、如你看到网页展示的文档有www.zixin.com.cn水印,是因预览和防盗链等技术需要对页面进行转换压缩成图而已,我们并不对上传的文档进行任何编辑或修改,文档下载后都不会有水印标识(原文档上传前个别存留的除外),下载后原文更清晰;试题试卷类文档,如果标题没有明确说明有答案则都视为没有答案,请知晓;PPT和DOC文档可被视为“模板”,允许上传人保留章节、目录结构的情况下删减部份的内容;PDF文档不管是原文档转换或图片扫描而得,本站不作要求视为允许,下载前自行私信或留言给上传者【自信****多点】。
5、本文档所展示的图片、画像、字体、音乐的版权可能需版权方额外授权,请谨慎使用;网站提供的党政主题相关内容(国旗、国徽、党徽--等)目的在于配合国家政策宣传,仅限个人学习分享使用,禁止用于任何广告和商用目的。
6、文档遇到问题,请及时私信或留言给本站上传会员【自信****多点】,需本站解决可联系【 微信客服】、【 QQ客服】,若有其他问题请点击或扫码反馈【 服务填表】;文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“【 版权申诉】”(推荐),意见反馈和侵权处理邮箱:1219186828@qq.com;也可以拔打客服电话:4008-655-100;投诉/维权电话:4009-655-100。