拮抗炭疽病的茶树内生菌筛选、鉴定及培养条件优化_郑世仲.pdf
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1、茶叶科学 2023,43(2):205215 Journal of Tea Science www.tea- 收稿日期:2022-09-18 修订日期:2022-12-06 基金项目:福建省自然科学基金(2020J01425)、宁德师范学院校级中青年项目(2020Q101)、宁德师范学院人才引进项目(2020Y013)作者简介:郑世仲,男,副教授,主要从事微生物生化和园艺生物技术研究。*通信作者: 拮抗炭疽病的茶树内生菌筛选、鉴定及培养条件优化 郑世仲,周子维,陈晓慧,蔡烈伟,江胜滔,刘盛荣*宁德师范学院生命科学学院,福建 宁德 352100 摘要:为筛选高效拮抗茶树炭疽病的内生细菌,以茶树健
2、康叶片为材料,采用平板对峙拮抗法进行筛选,并对筛选到的菌株进行鉴定、抑菌效果评价及培养条件优化。从分离的 162株内生细菌中筛选到 1株对茶树胶孢炭疽菌有较好抑制效果的拮抗细菌 X13。形态学、生理生化鉴定及 16 S rDNA 系统进化发育分析显示,分离的菌株 X13 为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。菌株 X13 对病原菌菌丝生长抑制率为 61.6%。生长曲线表明,菌株 X13 对数生长期为接种后 214 h。响应面优化的培养条件为 4.0%(质量百分浓度)玉米粉,1.0%(质量百分浓度)的硝酸钠,接种量 3.5%(体积分数)。本研究结果可为茶树炭疽病防治及生防菌剂的开
3、发提供重要参考。关键词:茶树;炭疽病;内生细菌;枯草芽孢杆菌;培养条件 中图分类号:S517.1;S435.711 文献标识码:A 文章编号:1000-369X(2023)02-205-11 Screening,Identification and Culture Condition Optimization of Antagonistic Endophytic Bacteria Against Gloeosporium theae-sinensis Miyake ZHENG Shizhong,ZHOU Ziwei,CHEN Xiaohui,CAI Liewei,JIANG Shengtao,
4、LIU Shengrong*College of Life Sciences College,Ningde Normal University,Ningde 352100,China Abstract:To screen the antagonistic endophytic bacteria against Gloeosporium theae-sinensis Miyake,the healthy leaves of tea plants were utilized as materials,and the plate antagonistic method was used.The is
5、olated bacteria were identified and evaluated for antimicrobial efficacy.The culture conditions were optimized using response surface methodology.One antagonistic bacterium X13 was screened from 162 strains of endophytic bacteria isolated,which had a good inhibitory effect on Colletotrichum gloeospo
6、rioides.The strain X13 was identified as Bacillus subtilis through morphological observation,physiological and biochemical tests,and 16S rDNA phylogenetic analysis.The inhibitory rate of strain X13 on the mycelial growth of C.gloeosporioides reached 61.6%.The logarithmic growth was between 2-14 h.Th
7、e optimal culture conditions were 4.0%(mass percentage concentration)corn flour,1.0%(mass percentage concentration)NaNO3,and 3.5%(volume fraction)inoculation.This study laid a key theoretical foundation for the prevention of the tea pathogen G.theae-sinensis and the development of its biocontrol age
8、nts.Keywords:tea plant,Gloeosporium theae-sinensis,endophytic bacteria,Bacillus subtilis,culture condition 茶树(Camellia sinensis)属山茶科山茶属的常绿双子叶木本植物,是我国重要的经济DOI:10.13305/ki.jts.2023.02.006206 茶 叶 科 学 43 卷 作物。炭疽病是茶树叶部的主要病害之一1-2,且在福建省等湿热地区最容易发生和流行。茶炭 疽 菌 病(Gloeosporium theae sinensis Miyake)是由茶刺盘孢等炭疽菌属真菌
9、引起的。茶炭疽菌属半知菌亚门、黑盘孢目、盘长孢 属,胶 孢 炭 疽 菌(Colletotrichum gloeosporioides)为茶树常见的一种炭疽病病原菌3-4。茶炭疽菌主要为害茶树叶片,从叶尖或叶缘开始发病,开始呈水渍状浅绿色,逐渐增大,形成形状不规则的大病斑,中后期引起大量叶片脱落,影响茶树生长,造成茶叶产量和质量下降,给茶园造成巨大的经济损失,危害茶产业发展5-7。植物病虫害的防治主要有物理、化学和生物防治 3 种方法,但化学防治会引起环境污染和农残等问题。微生物制剂等生物防治法具有对人畜无毒、不污染环境和持效性长等优点,已受到广泛重视和开发利用,大量研究表明,利用拮抗微生物制备
10、生防菌剂防治茶树等植物病害具有很大潜力6,8-10。拮抗微生物主要通过土壤或植物体进行分离筛选,土壤筛选的拮抗菌多为产抗生素的放线菌11-12。内生细菌是植物内生菌群的重要组成,通过不同方式长期定殖寄生在植物体内,与寄主长期协同进化,促进植物生长,同时对抵御病害又起重要作用,因此,植物内生菌成为开发微生物农药防治植物病害的重要途径。植物内生菌的抑菌机理主要表现为合成水解酶、抗生素和植物生长调节剂等次生代谢物质,杀死或抑制病原菌生长,增强植物体自身抵抗力,或诱导植物免疫应答等途径来抑制病原菌生长,降低病原菌的侵染效率和致病性,而内生菌自身又对寄主植物生长没有危害甚至有生长调节作用13。植物内生细
11、菌在茶树、油茶和花卉果树等植物生长过程的生理作用和病害防治中的作用已经被逐步发掘14-16。茶树炭疽病病征主要表现在成叶,其危害在很多茶区没有引起足够重视,但茶树炭疽病的发生,不但影响茶树生长,甚至可能诱导茶树次生代谢物质发生变化,结果影响茶叶产量与品质。目前,国内外对茶树炭疽病开展了广泛研究,但主要针对炭疽病病原,而病害的生物防治研究较少。本研究以茶树分离到的胶孢炭疽菌为病原指标菌,从茶树叶片分离筛选对茶炭疽病病原菌具有较强拮抗作用的内生细菌,并对分离到的拮抗菌进行鉴定和抑菌效果评价,优化培养条件,为开发茶树炭疽病生防菌剂提供依据。1 材料与方法材料与方法 1.1 试验材料 供试炭疽病病原菌
12、胶孢炭疽菌,为发生炭疽病病害的茶树叶片分离得到,保存于闽东特色生物资源福建省高校工程研究中心微生物研究室;健康茶树叶片从茶树种植基地(福建宁德)采集,作为内生细菌分离材料;基础液体培养基,其组成按质量分数为葡萄糖 1.5%,蛋白胨 1.0%,酵母膏 0.5%,KH2PO4 0.15%,K2HPO4 0.1%,MgSO47H2O 0.05%,MnSO4H2O 0.01%,FeSO47H2O 0.01%,CaCl2 0.15%配制,调 pH 值至 7.0。1.2 试验方法 1.2.1 菌株分离 取茶树成熟的健康叶片 5.0 g,用 70%乙醇溶液漂洗 23 次,10%的 NaClO 浸泡 5 mi
13、n,无菌水漂洗 45 次,晾干,50 mL 无菌水研磨。研磨液稀释至 10-4倍,吸取 0.1 mL 稀释液至牛肉膏蛋白胨培养基平板,涂布,37 倒置培养,长出菌落后根据菌落形态特征挑取单菌落,进一步划线纯化、保种。1.2.2 拮抗菌筛选 初筛,采用平板对峙培养法。PDA 平板中心位置接种茶树胶孢炭疽菌菌饼(直径7.0 mm),周围 10.0 mm 等距离接种分离的细菌,以仅接种茶树胶孢炭疽菌菌饼为对照,25 恒温箱培养。对照长至培养皿近边缘时,测量菌落直径,计算抑制率。抑制率=(对照炭疽菌菌落2期 郑世仲,等:拮抗炭疽病的茶树内生菌筛选、鉴定及培养条件优化 207 直径处理直径)/对照炭疽菌
14、菌落直径100%。复筛,采用琼脂扩散法。胶孢炭疽菌在PDA 平板 25 培养 5 d,无菌水洗涤,制备 1105 CFUmL-1孢子悬液,取 100 L 孢子悬浮液涂布 PDA 平板,每平板上放置 3 个牛津杯,加入 150 L 初筛菌株发酵滤液,以无菌水为对照,培养 4 d,观察抑菌情况和测量抑菌圈大小。1.2.3 拮抗菌的鉴定 形态学与生理生化鉴定,参照伯杰氏细菌鉴定手册17。显微镜观察形态,测试硝酸盐还原、吲哚试验、葡萄糖发酵等生理生化特性,对筛选的拮抗细菌进行初步鉴定。16 S rDNA 序列鉴定。EasyPure Genomic DNA Kit(全式金生物科技公司)基因组提取试剂盒提
15、取细菌基因组 DNA,微量核酸检测仪(Thermo Scientific)检测 DNA 浓度和纯度;引物 27F/1492R(27F:5-AGAGTTTGATCC TGGCTCAG-3,1492R:5-GGTTACCTTGT TACGACTT-3)扩增 16 S rDNA 序列,PCR 反应体系 25 L,扩增程序为:95 预变性 5 min;95 变性 30 s,60 退火 30 s,72 延伸 90 s,35个循环;72 延伸 10 min。EasyPure Quick Gel Extraction Kit(全式金生物科技公司)胶回收试剂盒纯化回收后克隆,阳性克隆子送华大基因测序。测序结果
16、进行 NCBI-BLAST 同源性序列比对分析,并从中下载相似度较高的序列,用MEGA 7.0 软件(Neighbor-Joining,NJ 邻位相连法)构建分子系统遗传进化树。1.2.4 种子液制备 将活化后的分离菌株 X13 刮取 1 环接入50 mL 灭菌的营养肉汤(250 mL 三角瓶),37 摇床 200 r min-1培养 20 h,即为液体种子液。1.2.5 生长曲线测定 种子液按 3.0%(体积分数)接种量接入装有 50 mL 基础培养基的 250 mL 三角瓶,摇床培养条件 200 rmin-1和 37,每 2 h 取培养液。以灭菌后的基础培养基为空白对照,分光光度计测定 O
17、D600值,3 个平行培养作为重复。1.2.6 响应面优化试验设计(1)单因素试验:碳源筛选,供试碳源为可溶性淀粉、大豆粕、麸皮、甘露醇、蔗糖和玉米粉,按 2.0%(质量百分浓度)添加量代替基础培养基中的葡萄糖,3.0%(体积分数)接种量接入 X13 种子液。发酵培养试验的装液量为 250 mL三角瓶装 50 mL培养基,37、200 rmin-1摇床培养,14 h 后测试发酵液OD600值,筛选出最适碳源。设置最佳碳源浓度范围为 1.0%5.0%,采用相同方法确定适宜的浓度。每次试验 3 个独立的平行培养作为重复。氮源筛选,大豆粕、硫酸铵、硝酸钠、尿素作为氮源,添加量 2.0%(质量百分浓度
18、),代替基础培养基中的蛋白胨,其他条件同上,确定最适氮源及合适浓度。接种量确定,以最适碳源、氮源及浓度配制培养基,按 2.0%、3.0%、4.0%、5%和 6.0%(体积分数)接种量接种,其他条件同上,确定合适的接种量。(2)Box-Behnken 试验:单因素试验基础上,Box-Behnken 试验设计进行响应面优化,试验设计采用 Design-Expert 8.0 软件。玉米粉浓度(A)、硝酸钠浓度(B)和接种量(C)3 个因素为自变量,菌体生长量 OD600值为响应值进行 3 因素 3 水平的 Box-Behnken试验设计。试验因素及水平见表 1。以 OD600值试验结果进行多元二次回
19、归分析,建立自变量与响应值之间定量关系的数学模型,F 值检验评价模型的可靠性,相关系数(R2)作为模型拟合程度的指标,P 值小于0.05 视为变量显著。1.2.7 数据处理 数 据 以 平 均 值 标 准 差 或 平 均 值(Box-Behnken 试验)的形式表示。采用 Excel 2007和Design-Expert 8.0进行绘图及统计分析。208 茶 叶 科 学 43 卷 表 1 Box-Behnken 试验因素及水平 Table 1 Variables and their levels used in Box-Behnken design%水平 Level A 玉米粉 A corn
20、flour B 硝酸钠 B NaNO3 C 接种量 C inoculation 1 3.0 0.5 2.0 0 4.0 1.0 3.0 1 5.0 1.5 4.0 2 结果与分析结果与分析 2.1 拮抗细菌筛选 从茶树叶片共分离到 162 株具有不同形态的茶树内生细菌菌株,并进一步初筛、复筛。其中,菌株 X13 对茶树炭疽病病原菌抑制率和抑菌圈直径最大,抑制率达到 61.6%,抑菌圈直径 17.9 mm。因此,选择 X13 菌株用于后续试验。图 1 为菌株 X13 与茶树炭疽病病原菌的拮抗作用图。2.2 菌株 X13 的鉴定 2.2.1 形态学与生理生化鉴定 菌株 X13 菌落圆形,呈乳脂色,
21、不透明,前期表面较光滑,后期有明显褶皱,边缘不整齐;革兰氏染色阳性,菌体杆状,有芽孢,无 荚膜,周生鞭毛;好氧生长,能利用葡萄糖、甘露醇和木糖发酵产酸,可水解明胶,能利用柠檬酸盐,能分解色氨酸形成吲哚,硝酸盐反应和 V-P 检测阳性。参照伯杰氏细菌鉴定手册,初步确定 X13 菌株为芽孢杆菌属。2.2.2 16 S rDNA 鉴定 菌株 X13 的 16 S rDNA 序列长度 1 449 bp,序列已提交保存于 GenBank,NCBI 登录号OP420513.1。基于 16 S rDNA 序列构建的系统遗传进化树见图 2。由图 2 可知,X13 菌株和枯草芽孢杆菌(Bacillus subt
22、ilis)YL1 在进化树的同一分支,且根据 NCBI 数据库比对结果,X13 菌株与 YL1 的 16 S rDNA 序列相似度为 99.72%,因此,结合形态学与生理生化鉴定结果,确定分离的菌株 X13 为枯草芽孢杆菌。图 1 菌株 X13 对胶孢炭疽菌的平板对峙试验 Fig.1 The inhibitory effects of antagonistic bacteria X13 on C.gloeosporioides 注:A 为试验组,B 为对照组Note:A,experimental group.B,control group 2期 郑世仲,等:拮抗炭疽病的茶树内生菌筛选、鉴定及培
23、养条件优化 209 2.3 菌株 X13 的生长曲线 菌株X13在基础培养基的生长曲线如图3所示,菌株的延滞期为 2 h,214 h 为对数生长期,1424 h 处于稳定期,24 h 后开始进入衰亡期。说明菌株 X13 生长速度快,生长旺盛,对营养要求不严格,易培养。发酵接种时,种子液以培养 1014 h 为宜,此时活性高、繁殖能力强,且活菌数高。2.4 单因素试验结果 2.4.1 不同碳源和氮源对菌株 X13 生长的影响 如图 4 所示,在供试的 6 种碳源中,以玉米粉作为碳源时稳定期的菌体生长量最大(图4A);随玉米粉添加量不断增加,菌体生长量呈先增加后降低的趋势;添加量为 4.0%时,菌
24、株 X13 生长量最高(图 4B)。因此,玉米粉为 X13 菌株的最适碳源,添加量为 4.0%。由图 4C 和图 4D 可以看出,硝酸钠(NaNO3)作为氮源时,稳定期 X13 菌株生长量最高。不同 NaNO3添加量对 X13 菌株生长有明显的影响,菌体生长量随 NaNO3添加量的增加呈先增加后降低的趋势,NaNO3添加图 2 枯草芽孢杆菌 X13 系统进化树 Fig.2 Phylogenetic tree of strain X13 图 3 菌株 X13 生长曲线 Fig.3 Growth curve of B.subtilis strain X13 5.04.54.03.53.02.52.
25、01.51.00.50OD600 0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24 26时间 Time/h 210 茶 叶 科 学 43 卷 量为 1.0%时,X13 菌株生长量达到最大值。因此,NaNO3为最适氮源,添加量为 1.0%。2.4.2 不同接种量对枯草芽孢杆菌 X13 菌株生长影响 由图 5 可知,接种量对 X13 菌株生长有一定的影响,接种量为 3.0%时,X13 菌株生长量达到最大值,进一步增加接种量,生长量呈现降低趋势,因此,最佳接种量为 3.0%。2.5 响应面优化 2.5.1 Box-Behnken 试验结果及回归模型建立 Box-Behnken 试验
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