化学信息学省公开课一等奖全国示范课微课金奖PPT课件.pptx

1,绪论,Slide Title,Body Text,Second Level,Third Level,Fourth Level,Fifth Level,*,化学信息学,胡 春,沈阳药科大学,20,16,年,10,月,13,日,1/32,化学信息学,绪论,化合物表示法,化学数据库介绍,Internet,化学化工信息资源,分子结构信息与计算机推演,化学数据分析处理方法,化工过程计算与仿真,2/32,邵学广、蔡文生（南开大学）编著,化学信息学,（第三版）,科学出版社,年出版,本书,年出版第,1,版，,年出版第,2,版，原为,科学版硕士教学丛书,之一。,邵学广课题组,(,南开大学化学信息学试验室,),网站链接,联机文件检索,1.1,美国化学文摘,1.1.1,美国化学文摘和,SciFinder,介绍,1.2 Web of Science,1.4,期刊全文数据库,1.4.1 Science Direct,1.4.2 ACS Publications,1.4.3 RSC Publishing,1.4.4 Springer Link,1.4.5 Wiley Online Library,1.5,国内学术期刊数据库,1.5.1 CNKI,1.7,专利文件查询,第,2,章 网络图书与网络期刊,第,3,章 数据库资源,3.1,晶体结构数据库,3.2,波谱数据库,3.3,网上化学手册,3.3.1,化学元素周期表,3.3.2,化合物基本性质数据库,3.3.3,物理化学常数,第,4,章 化学信息资源查询,4.1,查询,4.2,导航,4.3 ChIN,介绍,4.4,商业信息,4.5,化学机构信息,第,5,章 化学信息计算机表示与建模,5.1,化合物结构编码,5.2,分子图形学,第,6,章 计算机辅助结构解析与合成设计,第,7,章 分子模拟,7.1,量子力学,7.2,分子力学,7.4,波谱模拟,7.4.1,1,H-NMR,谱量子化学模拟,7.4.2,13,C-NMR,谱计算机模拟,第,8,章 进化计算与优化算法,第,9,章 小波分析,第,10,章 多元校正与因子分析,本书目录（部分）,4/32,选取教材,缪强（南京大学）编著,化学信息学导论,高等教育,出版社,年出版,5/32,主要参考书目,陈明旦、谭凯编著，,化学信息学,（第二版），化学工业出版社,年出版,李梦龙、文志宁、熊庆编，,化学信息学,，化学工业出版社,年出版,德约翰,加斯泰格尔、托马斯,恩格编著，梁逸曾等译，,国外优异化学著作译丛,化学信息学教程,，化学工业出版社,年出版,李梦龙、王智猛、姜林等编著，,化学软件及其应用,，化学工业出版社,年出版,李欣、齐晶瑶、韩喜江编著，,基础化学信息学,，哈尔滨工业大学出版社,年出版,余向春编著，,化学文件及查阅方法,（第三版），科学出版社,年出版,6/32,李梦龙、王智猛、姜林等编著,化学软件及其应用,化学工业出版社,年出版,李梦龙课题组,(,四川大学化学与生物信息学中心,),网站链接,化学软件概论,第,1,节 软件概述,第,2,节 化学软件分类,第,3,节 基于互联网化学软件,第,4,节 化学软件网络资源,第,5,节 化学软件发展趋势,第二章,ChemOffice,使用,第三章,ChemSketch,及其它绘图软件,第,8,节 其它化学绘图软件,第,9,节 化学绘图软件比较,第四章 国产化学软件介绍,第,1,节 化学金排,第,2,节 超级化学助手,第,3,节 化学品电子手册,第五章 化学试验模拟,第,1,节,ChemLab2.3,概述,第六章 虚拟仪器开发工具,LabVIEW6.1,第七章 试验室信息管理系统,第,1,节,LIMS,（试验室信息管理系统）介绍,第八章 基于算法化学计算软件,第,1,节,MATLAB,软件,第九章 计算机辅助化学教学软件,第十章 化学信息与网络数据库构建,8/32,其它参考书目,王荣民、杜正银主编，,化学化工信息及网络资源检索与利用,（第三版），化学工业出版社,年出版,张发爱、赵斌编著，,计算机在材料和化学中应用,，化学工业出版社,年出版,李谦、毛立群、房小敏主编，,计算机在化学化工中应用,，化学工业出版社,年出版,曾炜、孙延辉、李红霞编著，,ChemOffice,实用教程,，化学工业出版社,年出版,张昌松、郭晨洁等编著，,Origin7.5,入门与提升,，化学工业出版社,年出版,冉鸣主编，,化学教育工具软件,，化学工业出版社,年出版,王正烈、王元欣编著，,Beilstein,有机化学手册使用指南,，化学工业出版社,年出版,彭智、陈悦编，,化学化工惯用软件实例教程,，化学工业出版社,年出版,9/32,李谦、毛立群、房小敏主编,计算机在化学化工中应用,化学工业出版社,年出版,该书主要内容：,计算机文件检索,文件管理软件,Endnote,Excel,在正交试验设计和化工最优化中应用,化学编辑软件,ChemSketch,数据处理软件,Origin,绘制示意图软件,Visio,化学化工计算软件,Matlab,化工过程模拟软件,10/32,冉鸣主编,化学教育工具软件,化学工业出版社,年出版,该书主要内容：,化学编辑软件,ChemSketch,ChemWindows,晶体结构处理软件,Diamond,三维空间结构表示软件,MS Viewer,虚拟化学试验室,COREL Chemlab,11/32,彭智、陈悦编,化学化工惯用软件实例教程,化学工业出版社,年出版,该书主要内容：,Word,和,PPT,在化学中应用,化学编辑软件,ChemOffice,数据处理软件,Origin,绘制示意图软件,Visio,12/32,第1章 绪论,13/32,什么是化学信息学？,化学信息学(,ChemoInformatics,Chemical informatics),或称信息化学，是化学科学一门新、交叉领域分支，它是伴随计算机化学和化学信息网络化不停发展而逐步形成，化学信息学一词首次提出于1987年诺贝尔化学奖取得者,J.M.Lehn,教授获奖汇报中。,关于化学信息学定义及研究领域，当前国内外学者有很大争论，并没有太多共识。,“化学信息学”一词高频出现在,年9月在南京召开了第2届全国化学信息学会议。,14/32,什么是化学信息,到了20世纪，人们认为化学是研究分子科学。在这1中，美国化学文摘,(CA),上登录天然和人工合成分子和化合物数目已从1955万种，增加到当前,6513,万各种,(.12),。没有别科学能像化学那样制造出如此众多新分子、新物质。尤其是20世纪后期合成化学大发展，人们已经搜集了大量功效分子信息。包含它们合成、结构、性质等等，现在还在以越来越快速度合成出新化合物。许多工作仅为创造新分子或新结构，无意于它们实际用途。也有些即使考查过某种性质，不过可能当初遗漏另一主要性质。况且，当我们总结结构与功效关系时，需要功效表现有差异一系列相关化合物资料，哪怕是没有实际用处化合物。所以，我们越来越需要结构性质功效资料。,15/32,化学信息学发展概况,CAS is the leading provider of organic,inorganic,and biosequence substance information.,CAS also provides specialized databases of chemical reactions,regulated chemicals,commercially available chemicals and Markush substance information.,Date,Sun Aug 27 04:54:17 EDT,Count,29,775,159,organic and inorganic substances,57,804,253 sequences,CAS RN,904733-65-9 is the most recent CAS Registry Number,CAS Registry Number,www.cas.org/content/counter,16/32,化学信息学发展概况,CAS is the leading provider of organic,inorganic,and biosequence substance information.,CAS also provides specialized databases of chemical reactions,regulated chemicals,commercially available chemicals and Markush substance information.,Date,08/22/08:31:29 EST,Count,49,436,873,organic and inorganic substances,61,183,936,sequences,CAS RN,1174985-34-2,is the most recent CAS Registry Number,17/32,18/32,年,3,月,19/32,年,12,月,7,日,20/32,年,11,月,14,日,21/32,年,10,月,13,日,22/32,什么是化学信息,另外，经过长久积累，堆起了一座各种各样物质信息大山。它是埋藏着大量宝藏知识资源，而且这座大山还在以极快速度增加。可是当我们需要寻找含有某种功效化合物时，又去合成各种各样化合物提供筛选。所以，我们应该意识到从这座信息大山中能够发觉有用物质。信息技术包含计算机智能化给我们带来从信息大山中快速挖掘功效化合物和基本数据可能，这些基本数据是处理问题基础。,23/32,什么是化学信息,化学信息主要起源有：,（1）传统文本统计中化学信息。,（2）因特网中化学信息。它是指化学信息网络化，主要有联机文件检索、数据库资源、化学机构信息等。（3）计算机模拟取得化学信息。它是指借助计算机和一些软件对化学物质性质、化学反应、化学过程等进行模拟，以实现一些用试验伎俩难以完成或无法完成任务。如化学波谱模拟、化学反应动力学模拟、分子模拟。,（4）用化学计量学方法取得信息。它是指利用计算机和应用数学以及统计学方法在化学尤其是在分析化学中应用来确定最适当分析方法、选择最优测量过程以及怎样对试验原始数据进行处理以从中提炼新、更多有价值化学信息。,24/32,化学信息学,当前化学领域知识并非都来自于传统试验室经验测量，其中部分是依据已经有知识和定理经过计算机推演、大规模计算预测与模拟得到。为此，美国化学会在期刊,Journal of Chemical Information and Computer Sciences,上增加了副标题“,Includes Chemical Computation and Molecular Modeling”。,化学信息学正在设法提供一个以化学结构为框架通用化学语言，来组织化学领域全部知识。,25/32,化学信息学,化学信息学是近几年发展起来一个新化学学科，它利用计算机技术和计算机网络技术，对化学信息进行表示、管理、分析、模拟和传输，以实现化学信息提取、转化与共享，揭示化学信息实质与内在联络，促进化学知识创新和发展。,26/32,化学信息学,化学信息学研究内容主要包含：,（1）利用计算机技术和计算机网络技术对化学信息进行表示和计算机管理；,（2）利用计算机技术对复杂化学信息进行解析，以快捷、方便方式最大程度提取和利用有用信息；（3）利用计算机对化学信息和化学体系进行模拟；,（4）利用计算机和计算机网络技术搜集、传输和共享化学信息。,27/32,化学信息学课程情况,美国化学会化学信息分会和图书馆协会在,Indiana,大学成立了化学信息教学资料交换中心（,The Clearinghouse for Chemical Information Instructional Materials(CCIIM)），,负责搜集、公布和分发化学信息资源。,美国化学会还设置了化学信息教育委员会（,American Chemical Society Division of Chemical Information Education Committee）。,美国、欧洲、澳大利亚很多大学开设了化学信息学类课程，美国,Indiana,大学已经有超出40人取得了化学信息学硕士学位。,28/32,化学信息学课程情况,我国教育部理科化学教学指导委员会也把“化学信息学”列入了,1998,年10月制订化学专业和应用化学专业化学教学基本内容中。,在,年由教育部高等学校化学类专业教学指导分委员会编制,高等学校化学类专业指导性专业规范,中，要求化学类专业化学教学基本内容需包含“化学信息获取、处理和表示”；化学试验教学要培养学生“含有查阅资料、获取信息能力”。,29/32,沈阳药科大学应用化学专业教学计划（学科基础课）部分,30/32,化学信息学,化学化工文件学,化学图形学,化学知识体系计算机表示、管理与网络传输,化学信息解析与处理,化学知识计算机推演,化学教育与教学当代技术与远程信息资源,31/32,Thank you very much!,32/32,