恶性肿瘤组织微卫星不稳定性的研究分解ppt课件.ppt

恶性肿瘤组织微卫恶性肿瘤组织微卫不稳定性的研究不稳定性的研究微卫星微卫星(microsatellite,MS),(microsatellite,MS),是是指指DNADNA基因组中小于基因组中小于1010个核个核苷酸的简单重复序列苷酸的简单重复序列,又称又称短串联重复短串联重复(short tandem(short tandem repeat,STR)repeat,STR)，是一种遍布于，是一种遍布于人类基因组的重复序列，一人类基因组的重复序列，一般为般为2 26 6个碱基重复，如个碱基重复，如(CA)n(CA)n、(GT)n(GT)n、(CAG)n(CAG)n等，等，尤以尤以(CA)n(CA)n重复序列最为常重复序列最为常见。见。其长度由重复单位的拷贝数其长度由重复单位的拷贝数决定，是一类呈高度多态的决定，是一类呈高度多态的遗传标记，不仅可用于基因遗传标记，不仅可用于基因组遗传连锁图的构建以及基组遗传连锁图的构建以及基因的定位与克隆，而且可用因的定位与克隆，而且可用于遗传性疾病的连锁分析和于遗传性疾病的连锁分析和基因诊断。基因诊断。遗传物质的突变是导致人类许多疾病(包括肿瘤)的主要原因,而引起遗传物质突变的直接诱因是不同类型的DNA损伤。其中多种原因造成的DNA双链分子的碱基错配是导致突变的主要DNA损伤类型之一。大量研究表明,从细菌、酵母到人体细胞都存在一种能修复DNA碱基错配的安全保障体系,这种保障体系是由一系列特异性修复DNA碱基错配的酶分子组成,被称为DNA错配修复系统(DNA mismatch repair system,MMR)。人体细胞中由于MMR系统的存在,可保持遗传物质的完整性和稳定性,避免遗传物质突变的产生,保证DNA复制的高保真度。微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)是指由于复制错误(replication error,RER)引起的简单重复序列的增加或丢失,也称RER阳性或RER表型。1993年，Altonen等首次发现，在HNPCC细胞中存在高频率的MSI后，又有很多学者在多种肿瘤中发现MSI。MSI作为肿瘤遗传不稳定一个敏感的检测指标已逐渐被大家接受。在以后的研究中，相继在肺癌，在以后的研究中，相继在肺癌，胃癌，白血病等其它肿瘤也发胃癌，白血病等其它肿瘤也发现微卫星不稳定性。现微卫星不稳定性。Li Li等报道等报道一组一组100100例包括头颈部肿瘤，膀例包括头颈部肿瘤，膀胱肿瘤及肺癌病例，用胱肿瘤及肺癌病例，用9 9个微卫个微卫星位点标记物筛选，发现星位点标记物筛选，发现3 3个及个及4 4个核苷酸重复序列更易出现插个核苷酸重复序列更易出现插入或缺失，入或缺失，2626例出现至少一个例出现至少一个位点的改变。位点的改变。显示微卫星不稳定性改变可作为肿瘤细胞的克隆标志，运用于肿瘤的检测。肿瘤常在抑癌基因位点出现染色体基因缺失，表现为等位基因杂合性丢失(Loss of heterozygosity),通过检测分析肿瘤杂合性丢失及其规律，可在染色体一定范围内发现肿瘤的抑癌基因及易感基因。目前已发现RER+肿瘤主要有3类：一类为散发性结直肠癌,这一类肿瘤细胞核型为近二倍体,病人预后较好；另一类为HNPCC病人发生的结直肠癌、子宫内膜癌以及卵巢癌,这一类肿瘤几乎都表现为MSI,与散发性结直肠癌比较,发病年龄较早；第三类为包括肺癌、乳腺癌和胰腺癌在内的其它肿瘤,这一类肿瘤MSI发生频率相对较低。近年来研究证实RER+是HNPCC、肺癌、乳腺癌、食管癌、膀胱癌的早期分子标志,也是慢性髓细胞性白血病的晚期分子标志,对肾母细胞瘤来说,不仅是晚期分子标志并与其恶性程度有关,对胃癌来说,不仅是其早期事件,而且与癌的恶性转移有一定联系。并发现MSI存在于病理证实为阴性的肿瘤旁切缘组织。目前已经知道,RER+大肠癌有以下特性；(1)发病年龄早,35岁以下大肠癌患者RER阳性比例最高；(2)多位于右半结肠,易发生肠内或肠外其它器官的多发性肿瘤,多发性肿瘤RER阳性率(80%)明显高于单发性肿瘤(11%),术后易再发其它原发恶性肿瘤；(3)DNA多为二倍体或近二倍体；(4)对某些化疗药物(如顺铂)有原发耐药性；(5)具有高突变特性,许多癌基因及抑癌基因(如RAS,p53,APC等)突变数目明显增多；(6)粘液腺癌多见,组织分化差,多浸润生长,肿块较大,但较少发生淋巴结转移,预后较好,而RER-的大肠癌多发生在左半结肠,多为多倍体。晚期胃癌、远端胃癌多为RER+,RER+表型在肠型和实体瘤中的频率显著高于印戒细胞癌；近端胃癌早期多为RER-。这说明与RER+癌发病机制不同。因此,检测不同肿瘤的MSI,对深入认识肿瘤病的基因变化是十分有帮助的。目前,需大力开展对人体多种肿瘤MSI的检测,了解各种肿瘤与MMR基因突变的关系,弄清肿瘤中MMR基因的突变类型及作用方式,建立更为简便的基因突变的检查技术并应用了临床。微卫星不稳定性的研究方法，目前主要以PCR技术为基础研究微卫星不稳定性改变，步骤为：(1)首先需确定特定染色体上特定微卫星位点标记，并根据其序列合成特异性引物。引物序列一般可根据特定位点直接从基因库中查询。（2）收集肿瘤组织及相应正常组织标本，酚、氯仿抽提，乙醇沉淀，提取基因组DNA。（3）PCR扩增。（4）扩增产物的检测。常用凝胶电泳，溴化乙锭染色后在紫外灯下观察，或放射自显影及银染等方法观察。（5）判断结果。若肿瘤组织较正常对照组织出现某一基因条带消失或密度减少50以上，可判断为杂和性丢失；若肿瘤组织出现基因条带的增多，即判断为不稳定性改变。存在的问题：通过对人体多种肿瘤MSI的检测,目前已初步对体细胞中MMR系统的功能以及MMR缺陷与肿瘤发生的相应关系有所认识,但此仅仅是深入研究的开始而已,因为(1)人类MMR基因不仅具有识别和修复DNA复制过程中出现的DNA错配的功能,有实验报道,该组基因还以某种方式参与细胞对增殖的调控,其确切机理及调节方式有待进一步研究。(2)大肠杆菌MutHLS系统中的MMR基因仅占大肠杆菌基因组中突变控制位点(murator loci)的一半。除MMR基因外,其余占半数的突变控制位点的基因组成了大肠杆菌细胞中的对突变产生具有明显抑制作用的体系。由于细菌与人体细胞在由于细菌与人体细胞在MMRMMR系系统上表现出极大的相似性统上表现出极大的相似性,因而因而推测人体细胞除推测人体细胞除MMRMMR系统外系统外,也也应含有类似于大肠杆菌的其它突应含有类似于大肠杆菌的其它突变抑制系统变抑制系统,该突变抑制系统也该突变抑制系统也应该在维持人基因组稳定性上发应该在维持人基因组稳定性上发挥重要作用挥重要作用,其功能失活也参与其功能失活也参与了肿瘤的形成。目前了肿瘤的形成。目前,对人体细对人体细胞中可能存在的此系统还不了解。胞中可能存在的此系统还不了解。(3)已有研究发现在hMSH2基因启动子区域含有一个p53蛋白质的识别位点,据此推论,hMSH2基因可能是受p53基因调控的一种靶基因,其正常功能在某种程度上依赖于p53基因的调节。因而某些肿瘤组织中MMR缺陷并非由于MMR基因突变所致,可能与MMR基因的调节基因变异有关。