分子生物学复习题1.doc

分子生物学思考题
一、名词解释
1、C值矛盾 2、DNA的重排 3、断裂基因 4、管家基因 5、奢侈基因 6、CpG岛 7、反式作用因子 8、顺式作用元件 9、RNA编辑 10、选择性剪接 11、CAP 12、回文序列 13、micRNA 14、信号肽 15、弱化子 16、增强子 17、绝缘体 18、沉默子 19、魔斑 20、上游启动子元件 21、SD序列 22、物理图谱 23、功能基因组学 24、增效突变 25、减效突变 26、转化 27、转导 28、转染 29、基因打靶 30、DNA芯片 31、反义核酸技术 32、终止子 33、转座子 34、模体 35、锌指 36、亮氨酸拉链 37、cDNA文库 38、基因组文库 39、启动子 40、终止子 41、分子伴侣 42、同尾酶 43、同裂酶 44、Southern 印迹 45、Northern 印迹 46、Western 印迹 47、原位杂交 48、基因治疗 49、基因敲除 50、副密码子

二、问答题
PCR的基本原理？
PCR引物设计的基本要求？
分子克隆中常用的工具酶及良好载体的条件？
核酸分子杂交的原理？
影响杂交的因素？
DNA芯片的原理？
某学生在用EcoR Ⅰ切割外源片段时，出现了星号活性，请分析可能的原因?
在序列5’—CGAACATATGGAGT-3’中含有一个6bp的 Ⅱ类限制性内切核酸酶的识别序列，该位点的序列可能是什么?
下面几种序列中你认为哪一个(哪些)最有可能是Ⅱ类酶的识别序列：
GAATCG，AAATTT， GATATC，ACGGCA?为什么?
当两种限制性内切核酸酶的作用条件不同时，若要进行双酶切，应采取什么措施?为什么?
按适当的顺序，列出将一种mRNA的 cDNA克隆到表达载体所用到的酶。
简述以粘粒为载体构建基因文库的原理
用限制性内切核酸酶切割 DNA后，经电泳检查，发现有拖尾现象，其可能的原因是什么?
病毒、原核、真核基因组的特点？
详述大肠杆菌色氨酸操纵子的调控机理。
乳糖操纵子的作用机制？
真核生物转录水平的调控机制？
真核生物转录后水平的调控机制？
表观遗传学研究内容是什么？
叙述由一段DNA序列形成多种蛋白产物的机制。
原核生物与真核生物启动子的主要差别？
原核生物和真核生物基因表达调控的异同？
哪三个序列对原核生物mRNA的精确转录是必不可少的？
激活蛋白（CAP）对转录的正调控作用？
什么叫原癌基因？原癌基因是通过什么途径活化的？
简述人类基因组计划成果体现的四个图谱。
列出真核生物mRNA与原核生物mRNA的区别。
在体内，rRNA和 tRNA都具有代谢的稳定性，而 mRNA的寿命却很短,原因何在?为什么真核生物核糖体RNA基因具有很多拷贝?
为什么说信使RNA的命名源自对真核基因表达的研究，比说源自对原核基因表达的研究更为恰当?
说明为什么mRNA仅占细胞RNA总量的一小部分(3％一5％)。
起始tRNA具有哪两种与其他 tRNA不同的特性?
区别rRNA和mRNA在翻译中的作用。
氨基酸分子如何与正确的tRNA分子连接?
DNA复制起始过程如何受DNA甲基化状态影响?
描述滚环复制过程及其特征。
比较真核生物与原核生物转录起始的第一步有什么不同。
阐述原核生物的转录终止。
(1)转录终止的两种主要的机制是什么?
(2)描述翻译怎样能调节转录终止。
(3)为什么在细菌转录终止中很少涉及到Rho因子?
(4)怎样能阻止转录的终止?
概括说明σ因子对启动子调节的辅助功能。
转录涉及模板链和编码链的分离，解释在转录中单链 DNA是怎样被保护的。
解释因子是怎样选择专一性启动子共有序列而启动不同基因表达的(考虑对环境压力的应答)
说明因 RNA聚合酶—启动子不同的相互作用如何导致不同基因的转录。
列举两种受调控蛋白控制的、与氨基酸的生物合成有关的操纵子。
什么是安慰诱导物?
葡萄糖是如何影响涉及糖代谢的操纵子(葡萄糖敏感型操纵子)的表达?
在大多数细菌操纵子中，结构基因通常紧靠在一起并由单个操纵序列—启动子区调控，而在一些例子中结构基因分散在染色体上。请问这些基因是如何以简单的方式达到协同调节的。
为什么基因组 DNA在用限制性内切核酸酶消化时，哺乳类的卫星 DNA会产生特异的带?
增强子具有哪些特点?
哪些转录因子含有 TBP?为什么它们被称为定位因子?请用一个模型解释为什么所有三种RNA聚合酶都能与 TBP发生作用?
RNA聚合酶的内部启动子位于起始位点下游50个核苷酸的位置，它是如何被定位并正确起始转录的?
真核生物中，基因的表达受不同水平的调控，请列举其中3种。
甾醇类转录因子与锌指蛋白类转录因子的区别是什么?
亮氨酸拉链蛋白所识别的 DNA有何特点?如何理解亮氨酸拉链转录因子的二聚体结构同识别位点的关系?
虽然同源异型蛋白与锌指蛋白差别很大，但是它们识别 DNA序列的结构元件相似的，这个元件是什么?
举例说明单链核酸中形成茎环结构的重要性
比较RNA聚合酶 Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ催化的转录终止过程和转录产物3’端的形成
简述真核细胞中翻译终止的过程。
真核与原核核糖体的主要区别是什么?
简述真核与原核细胞中翻译起始的主要区别。
氨酰tRNA合成酶的功能是什么?
欲将一真核生物的结构基因克隆后转移到原核生物(如Ecoli助中进行表达，克隆时应注意哪些问题?
Prokaryotic promoter与Eukaryotic promoter的基本结构。
Enhancer与Attenuator的功能与原理。
paracodon与codon in codon的特点与功能。
DNA芯片的原理

三、证明分析题
1、试证明一个基因中只有一条DNA链作为模板被转录。
2、经过测序分析，欲克隆的一段DNA序列如下:
GAATTCCGGCGGCGGGGTTTTCATTATTATGATCGTTGACATGGGACAAGGGGCTCCTATAATAGGTGC
ATTTGTAGGGGATGTGGCCACATGATAGCGCGTCGAGGCATTCAGGACCGATATTGTCATATTGCCAGC
ATGCTGCAGCGCGCCAACTTAGTTACAACTTATACGATGATTTTAAAAAAAGAATATCAAATAGCCATC
CACCCGAAAGACCACCGCAAGTATCGGTACGATCGTACCAGCACACACCACAGTCGCCAGTCTGTTACC
AAATAATAAAGTTGATAATTAATTCACATCTACCTGGGTAACCCAGGTAGATGTGAATTTTTAGAATTC
这段序列被克隆到某多拷贝质粒的一个EcoRI限制性位点，并表达了一个小肽，请找出这段序列中所含有的以下几个功能位点:
(1)两个EcoRI位点
（2）一个启动子
(3)一个转录起始位点
(4)一个转录终止子
(5)一个核糖体结合位点
(6)一个翻译起始密码子·
(7)一个翻译终止子
另请标出相应的调控序列及编码区的氨基酸。
3、 现分离了一DNA片段，可能含有编码多肤的基因的前几个密码子。该片段的序列
组成如下:
5' CGCAGGATCAGTCGATGTCCTGTG 3'
3' GCGTCCTAGTCAGCTACAGGACAC 5'
(1)哪一条链作为转录的模板链?
(2)mRNA的顺序是什么?
(3)此mRNA能形成二级结构吗?
(4)翻译从哪里开始?朝哪个方向进行?
(5)此DNA最可能是从原核细胞还是真核细胞中分离的?
4、用含中性碳源(例如甘油)的液体基本培养基培养E.coli不能诱导lacZ操纵子。一小时后在培养基中加入乳糖和再隔一段时间加人过量的葡萄糖分别会对lac操纵子的表达有什么影响?
5、当lacZ-或lacY-突变体生长在含乳糖的培养基上时lacZ操纵子中剩余的基因没有被诱导，解释是何原因。
6、 TFⅢA是5SrRNA基因表达所需的转录因子，这个蛋白含有9个锌指结构域，与5SrRNA基因内的一段序列和5SrRNA本身结合。
(1)如何定位TFTA蛋白的DNA结合位点?
(2)什么样的突变可以证明锌指是DNA结合所需的?
(3)有人发现TFⅢAC端缺失19个氨基酸后与DNA结合的能力与野生型一样，但
是不能激活5SrRNA基因的转录，请解释原因。
(4)Xenopus的卵母细胞中合成并贮存了大量的5SrRNA，随着5SrRNA的积累，
TFInnA与之结合，这对5SRNA基因的转录有何影响?调控这个过程的机制是
什么?