1、 ICS 65.020.01 CCS B 05 15 内蒙古自治区地方标准 DB15/T 27342022 向日葵总 DNA 快速提取及检测技术规程 Technical code of practice for rapid extraction and detection of total sunflower DNA 2022-07-29 发布 2022-08-29 实施 内蒙古自治区市场监督管理局 发 布 前言 本文件按照GB/T 1.12020标准化工作导则 第1部分:标准化文件的结构和起草规则的规定起草。本文件由内蒙古自治区农牧厅提出。本文件由内蒙古自治区农业标准化技术委员会(SAM/T
2、C 20)归口。本文件起草单位:内蒙古自治区农牧业科学院、内蒙古农业大学、内蒙古工程项目管理有限公司、内蒙古自治区农牧业技术推广中心、五原县农牧业技术推广中心、内蒙古自治区发展和改革委员会、巴彦淖尔市农牧业科学研究所、内蒙古大学、杭锦后旗农牧和科技局。本文件主要起草人:郭树春、李素萍、张艳芳、孙瑞芬、邵盈、于海峰、刘慧、李丽君、李二珍、段宇坤、聂惠、乔慧蕾、牟英男、张勇、张晓蒙、梁晨、张聪子、李有良、张立华、刘锦川。向日葵总 DNA 快速提取及检测技术规程 1 范围 本文件规定了向日葵总 DNA 提取、质量检测和保存等技术内容。本文件适用于向日葵根、茎、叶DNA的快速提取。2 规范性引用文件
3、本文件没有规范性引用文件。3 术语和定义 本文件没有需要界定的术语和定义。4 DNA 提取量及质量目标 单位样本DNA提取量不低于0.8 g1.2 g,DNA提取纯度A260/280 值在1.82.0之间。5 药品准备 药品准备见附录A。6 DNA 提取 样品准备 取向日葵48叶期的叶片、根、茎80 mg120 mg。样品研磨 1.5 mL离心管加入样品,液氮制冷,用磨砂尖头玻璃棒迅速研磨成粉末。DNA 抽提 DNA 抽提方法:a)离心管中加入 700 l 2%CTAB 提取液(药品配制见附录 A);b)将离心管置于 65 水浴锅中 1 h,期间每隔 10 min 轻轻摇动一次;c)取出后冷却
4、至室温,然后加入 700 l 氯仿/异戊醇(241)轻轻转动摇匀后静置 10 min。离心沉淀 离心沉淀方法:a)4 下 10000 rpm 离心 6 min;b)缓慢吸取上清液加入到预先加好 700 l 无水乙醇的离心管中,轻轻的上下颠倒混匀;c)放入 4 冰箱冷却 30 min;d)10000 rpm 离心 1 min;e)缓慢倒掉全部液体,1 mL 70%的乙醇漂洗固态 DNA 2 次,10000 rpm 离心 1 min,弃上清液。风干纯化 将6.4得到的沉淀物在超净工作台下风干,加入1TE 100l(1l 10 mg/ml RNase)溶解DNA,在37 水浴中水浴1 h去除RNA。
5、DNA 浓度和质量检测 紫外分光光度计测定DNA浓度,并将其稀释到20 ng/l,取5l稀释液,以DL2000 marker为对照,1%琼脂糖凝胶电泳检测。具体检测方法见附录B。7 保存 DNA质量检测合格后,-20 储存备用。8 注意事项 DNA提取过程中注意事项:加入 CTAB 后轻轻摇匀,防止基因链断裂;操作过程中,全程佩戴医用口罩和专用手套。A A 附录A (资料性)溶液配制 A.1 2%CTAB 溶液配制:CTAB 4 g,Nacl 16.364 g,1 M Tris-HCI 20 ml(PH8.0),0.5 M EDTA 8 ml,先用 70 ml ddH20 溶解,再定容至 20
6、0 ml 灭菌。A.2 1 M Tris-HCI 溶液配制:Tris6.06 g,加 40 ml ddH20 搅拌溶解,冷却后加浓盐酸约 2.1 ml 调PH 至 8.0,定容至 50 ml。A.3 0.5 M EDTA(pH8.0)50 ml 的配制:称取 9.306 g EDTA-Na22H20,加入超纯水 35 ml,剧烈搅拌,用约 1 g NaOH 颗粒调 pH 至 8.0,定容至 50 ml(EDTA 二钠盐需加入 NaOH 将 pH 调至接近 8.0 时,才会溶解)。A.4 10TE:取 5 ml 1 M Tris-HCI,1 ml 0.5 M EDTA,加入 44 ml 超纯水后
7、高压灭菌,室温保存。取 1 ml 10TE,加入 9 ml 灭菌后的超纯水即为 1TE。A.5 5TBE:称取硼酸 27.5 g,Tris 54 g,并且将 20 mL 的 0.5 molL-1 EDTA(pH=7.9)置于其中,加入 ddH2O 定容至 1 L。取 1 倍的溶液加入 9 倍的 ddH2O,即为 0.5TBE。B B 附录B (资料性)1%琼脂糖凝胶电泳检测 1%琼脂糖凝胶电泳检测方法:a)制备 1%琼脂糖凝胶(大胶用 70 ml 小胶用 50 ml):称取 0.7 g(0.5 g)琼脂糖置于锥形瓶中,加入 70 ml(50 ml)0.5TBE。微波炉加热煮沸 3 次至琼脂糖全
8、部融化,摇匀,即成 1%琼脂糖凝胶液;b)胶板制备:取电泳槽内的有机玻璃内槽(制胶槽)洗干净,晾干,放入制胶玻璃板。将内槽置于水平位置,在固定位置放好梳子,将冷却到 65 左右的琼脂糖凝胶液均匀小心地倒入内槽玻璃板上,使胶液缓慢展开,直到整个玻璃板表面形成均匀胶层,室温下静置直至凝胶完全凝固,垂直轻拔梳子,将凝胶及内槽放入电泳槽中,添 0.5TBE 电泳缓冲液至没过胶板为止;c)加样:在点样板上混合 DNA 样品和上样缓冲液,上样缓冲液最终稀释倍数应不小于 1 X,用 10 l 微量移液器分别将样品加入胶板的样品小槽内,每加完一个样品,应更换一个加样头,以防污染,加样时勿碰坏样品孔周围的凝胶面(注意:加样前要先记下加样的顺序);d)电泳:加样后的凝胶板立即通电进行电泳,电压 60 V100 V,样品由负极(黑色)向正极(红色)方向移动。电压升高,琼脂糖凝胶的有效分离范围降低。当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1 cm 处时,停止电泳;e)现察照相:在紫外灯下观察,DNA 存在则显示出条带,采用凝胶成像系统拍照保存。