西安地区新型冠状病毒肺炎患...CoV核酸检测复阳结果分析_赵海卫.pdf
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1、175现代检验医学杂志第 38 卷第 1 期2023 年 1 月J Mod Lab Med,Vol.38,No.1,Jan.2023西安地区新型冠状病毒肺炎患者康复期 2019-nCoV 核酸检测复阳结果分析赵海卫,孙珉,王娟,杨丽华,成蒙蒙,薛婧雯,王友,樊爱琳(西安秦皇医院医学检验中心,西安 710600)摘要:目的研究西安地区新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)患者康复期新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测复阳情况。方法对 2021 年 12 月 2022 年 2 月在西安秦皇医院的 873 例 COVID-19 患者康复期采集口
2、咽和鼻咽拭子,应用实时荧光定量 PCR 进行 2019-nCoV 核酸检测,核酸复阳结果按性别、年龄、标本类型、靶标基因和Ct值与转阴时间分别进行分组比较。结果核酸检测复阳患者共201例,阳性率为23.02%。不同性别(21.58%vs 24.81%)和年龄组(24.70%vs 25.90%)核酸复阳率之间差异无统计学意义(2=1.272,3.223,均 P0.05)。双拭子(鼻咽+口咽)联合检测复阳率明显高于单鼻咽或单口咽拭子(23.02%vs 19.01%,5.84%),且鼻咽拭子核酸复阳率明显高于口咽拭子,差异均有统计学意义(2=8.699,121.5,69.59,均 P0.05)。双靶
3、标基因阳性标本数明显高于单靶标 N 或 ORF1ab 基因(55.30%vs 28.57%,16.13%),且单靶标 N 基因阳性标本数明显高于 ORF1ab 基因,差异均有统计学意义(2=31.83,72.51,9.679,均 P0.05)。不同区间 Ct 值组间核酸转阴时间差异有统计学意义(F=16.66,P0.001),且转阴时间与复阳时的 Ct 值呈显著负相关性(r=-0.539,P0.05).The combined detection rate of double swabs(nasopharynx and oropharynx)was significantly higher t
4、han that of single nasopharynx or single oropharynx swabs(23.02%vs 19.01%,5.84%),and the rate of nucleic acid reactivation of nasopharynx swabs was significantly higher than that of oropharynx swabs,and the differences were statistically significant(2=8.699,121.5,69.59,all P0.05).The number of doubl
5、e target gene positive specimens was significantly higher than that of single target N or ORF1ab genes(55.30%vs 28.57%,16.13%),and the number of single target N gene positive specimens was significantly higher than that of ORF1ab gene,and the differences were statistically significant(2=31.83,72.51,
6、9.679,all P0.05).There was a significant difference in the time of nucleic acid negative transformation between different Ct values(F=16.66,P0.001),and there was a significant negative correlation between the time of nucleic acid negative transformation and the Ct value at repositive time(r=-0.539,P
7、0.05).ConclusionThe rate of nucleic acid reactivation was still high in COVID-19 patients during the recovery period.The mechanism and cause of reactivation are unknown,and isolation management and health monitoring are still needed to be strengthened.作者简介:赵海卫(1987-),男,硕士,主管技师,研究方向:病原微生物感染及分子诊断,E-ma
8、il:。通讯作者:樊爱琳(1970-),女,博士,副主任医师,E-mail:。176现代检验医学杂志第 38 卷第 1 期2023 年 1 月J Mod Lab Med,Vol.38,No.1,Jan.2023Keywords:COVID-19;2019-nCoV;nucleic acid test;theresults repositive of nucleic acid test新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)是由新型冠状病毒(2019-nCoV)感染引起的急性呼吸道传染病,临床症状主要表现为干咳、发热和乏力1。自疫情暴发以来,经过两
9、年多的抗疫,我国在 COVID-19 防治方面已取得了阶段性的成果2。随着 COVID-19 患者大量治愈出院,健康监测成为了医学研究关注的焦点。2019-nCoV 核酸检测仍是 COVID-19 康复患者健康监测的重要指标。随着对治愈出院患者的持续观察,陆续有报道发现治愈患者出现核酸检测复阳,复阳原因及机制目前尚不明确,但截至目前,国内尚未报道核酸复阳者具有传染性3-5。国务院在新冠肺炎出院患者复诊复检工作方案(试行)中明确要求新冠肺炎患者治愈出院后应当继续隔离医学观察 14 天(康复期),康复期满进行核酸检测,并规定了核酸复阳的管理措施6。目前为止,针对COVID-19患者康复期核酸检测复
10、阳结果报道较少,本文对我院 873 例 COVID-19 患者康复期的 2019-nCoV 核酸检测复阳结果进行分析,为 COVID-19患者康复期核酸检测及隔离管理提供参考。1材料与方法1.1研究对象收集 2021 年 12 月 2022 年 2 月在西安秦皇医院进行康复的 COVID-19 患者共计 873例,入院时核酸检测均为阴性。男性 482 例,女性391 例;按年龄分组,30 岁 311 例,30 60 岁477 例,60 岁 85 例。基因测序证实毒株亚型为德尔塔变异株。1.2仪器和试剂重庆中元汇吉全自动核酸提取仪,西安天隆全自动医用 PCR 分析系统,重庆中元汇吉核酸提取试剂盒
11、(磁珠法),重庆中元汇吉 2019-nCoV 核酸检测试剂盒,北京康彻思坦生物 2019-nCoV 核酸(液体)质控品 S3(浓度为 5 000copies/ml)。1.3方法按西安疫情指挥部医疗专家组要求,同时采集康复期患者口咽和鼻咽拭子两份标本进行 2019-nCoV 核酸检测,取 200l 病毒液提取核酸,将 10l 核酸提取液加入到扩增试剂中,配置成 20l 体系扩增,内标基因、N 和(或)ORF 1ab基因扩增曲线同时呈 S 型,且 Ct 40,结果判为阳性,每批含三个阴性和一个弱阳性质控(S3 稀释10 倍)。两份标本均为阴性认为该患者达到出院标准,若有一份标本阳性则判该患者核酸复
12、阳。复阳患者无临床表现和影像学进展的,留院观察,并继续进行核酸检测,采样间隔 24h,连续两次检测均为阴性,则该患者达到出院标准。1.4统计学分析采用 SPSS20.0 软件对数据进行统计学分析,计量资料采用均数 标准差(xs)表示,两组间比较采用 t 检验,多组间比较采用方差分析,计数资料采用卡方(2)检验,采用Pearson 线性相关进行相关性分析,P 0.05 为差异有统计学意义。2结果2.1COVID-19 患者康复期核酸复阳率及不同性别、年龄组之间的比较873 例患者康复期共检出核酸复阳患者201例,阳性率为23.02%(201/873)。男性患者复阳率为 21.58%(104/48
13、2),女性患者复阳率为 24.81%(97/391),不同性别之间的差异无统计学意义(2=1.272,P=0.259)。30 岁患者复阳率为 19.61%(61/311),3060 岁患者复阳率为 24.74%(118/477),60 岁患者复阳率为25.88%(22/85),不同年龄组之间的差异无统计学意义(2=3.223,P=0.199)。2.2不同类型标本核酸阳性检出率比较201 例核酸阳性患者中,口咽拭子阳性患者 35 例,鼻咽拭子阳性患者 150 例,口咽拭子和鼻咽拭子均为阳性患者 16 例,鼻咽拭子阳性检出率为 19.01%(166/873),口咽拭子阳性检出率为5.84%(51/
14、873),双拭子(鼻咽+口咽)阳性检出率(23.02%,201/873)明显高于单鼻咽(2=8.699,P=0.003)或单口咽拭子(2=121.5,P0.001),鼻咽拭子阳性检出率明显高于口咽拭子(2=69.59,P0.001),差异均有统计学意义。2.3不同靶标基因核酸复阳标本占比及 Ct 值分析见表 1。217 份核酸阳性的口咽和鼻咽拭子标本中,双靶标基因阳性标本数明显高于单靶标基因(N或 ORF1ab),差异有统计学意义(N:2=31.83,P0.001;ORF1ab:2=72.51,P0.001),单靶标 N 基因阳性标本数明显高于 ORF1ab 基因,差异有统计学意义(2=9.6
15、79,P=0.002)。双靶标基因阳性标本的 N 和 ORF1ab 基因 Ct 值均明显低于单靶标基因阳性标本,差异有统计学意义(N:t=6.274,P0.001;ORF1ab:t=5.186,P0.001)。表 1不同靶标基因核酸复阳标本占比(%)及 Ct 值(xs)分析(n=217)靶标基因阳性标本数占比(%)Ct 值N6228.5737.620.83ORF 1ab3516.1338.160.96N+ORF1ab12055.3035.332.80/35.562.922.4不同区间 Ct 值核酸复阳患者占比及核酸转阴时间分析见表 2。201 例核酸复阳患者中,以靶标基因 Ct 值 35 的患
16、者为主,靶标基因 Ct 值177现代检验医学杂志第 38 卷第 1 期2023 年 1 月J Mod Lab Med,Vol.38,No.1,Jan.2023 30 的患者较少。不同区间 Ct 值组间核酸转阴时间差异有统计学意义(F=16.66,P0.001),且转阴时间与复阳时的 Ct 值呈显著负相关性(r=-0.539,P0.05)。表 2 不同区间 Ct 值核酸复阳患者占比及核酸转阴 时间(n=201,xs)组别阳性患者数阳性占比(%)转阴时间(天)Ct 3515577.111.631.4630Ct354120.402.782.01Ct 3052.494.802.17注:分组依据患者核酸
17、结果靶标基因最低 Ct 值。3讨论我国在疫情防控中积极采取有效措施,大多数感染患者得到了及时治疗并康复出院。随着康复患者出院,陆续报道出现核酸复阳,其机制目前尚不清楚,需进一步研究7。本研究对 873 例COVID-19 康复期核酸检测结果调查发现,核酸复阳率为 23.02%,高于胡星星等8报道的 15.96%,与 ZOU 等5报道的 20%接近,这种差异可能与患者人数及地域差异有关,也不排除与感染毒株亚型有关。本研究发现不同性别之间的核酸复阳率差异无统计学意义,与赵本南等9研究结果一致,不同年龄组之间核酸复阳率差异无统计学意义,因本研究未考虑患者免疫机制、基础疾病和治疗情况等因素,性别和年龄
18、因素是否会直接影响核酸复阳尚待进一步研究。COVID-19 属于呼吸道疾病,口咽和鼻咽拭子是主要检测标本,针对 COVID-19 患者康复期核酸复阳结果,本研究表明鼻咽拭子阳性检出率明显高于口咽拭子(P0.001),机制为鼻咽部病毒受体血管紧张素转移酶 2(Angiotensin converting enzyme 2,ACE2)表达量较高,康复期鼻咽部病毒载量(或核酸片段)高于口咽部10。此外,双拭子(鼻咽和口咽)联合阳性检出率明显高于单鼻咽或单口咽拭子(P35(见表 1),依据 Ct 值与病毒载量(或核酸拷贝数)呈负相关可推测,康复期患者体内病毒载量(或核酸拷贝数)普遍较低。此外,单靶标
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