生物化学蛋白质省公开课一等奖全国示范课微课金奖PPT课件.pptx
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,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,第二章,蛋白质结构与功效,一、概述,二、蛋白质基本组成单位氨基酸解,),三、蛋白质结构,四、蛋白质结构与功效关系,五、蛋白质主要性质、分离纯化与判定,1/92,了解蛋白质元素组成;掌握蛋白质基本结构单位氨基酸基本结构;了解氨基酸分类;了解稀有氨基酸和非蛋白质氨基酸;掌握氨基酸各种理化性质;掌握肽键、肽链和蛋白质一级结构概念,同时了解蛋白质一级结构表示方法;掌握二肽及多肽形成过程;了解蛋白质一级结构测定方法。,。,2/92,思索题,1.,蛋白质分为哪些类型?各行使何种功效?,2.,自然界存在氨基酸种类、结构、性质?,3.,肽键有何特点?对蛋白质构象形成有何,影响?,4.,何谓蛋白质一、二、三、四级结构?维,系蛋白质构象作用力有哪些?,5.,何谓蛋白质超二级结构和结构域?,6.,试述蛋白质一级结构和高级结构与功效,关系。,7.,何谓蛋白质变性作用与复性作用?,3/92,一、概述,(一)蛋白质生物学意义和元素组成,(二)蛋白质分类,4/92,(一)蛋白质生物学意义和元素组成,1.蛋白质生物学意义,(1)蛋白质生物学功效,多样性,酶催化功效、控制生长和分化、代谢调整功效、运动功效、运输作用、免疫保护作用、接收和传递信息、贮存营养功效、结构支持作用,。,(2)蛋白质生物学功效,复杂性,某一功效发挥往往受到各种原因影响与调整。,5/92,2.蛋白质元素组成,普通含有:,碳,(5055,),、,氮,(1518)、,氧,(2023)、,氢,(68)、,硫,(04)。,在一些蛋白质中,还含有一些,微量元素,如:磷、铁、铜、钼、碘、锌等。,蛋白质元素组成一个特点:,各种蛋白质氮含量比较恒定,平均值为16左右,。,用,凯氏定氮法,测定氮含量,计算蛋白质含量(由氮含量乘以6.25)出来。,6/92,(二)蛋白质分类,1.按蛋白质构象分类,2.按蛋白质功效分类,3.,按蛋白质组成和溶解性分类,7/92,1.,按蛋白质构象分类,分为,球状蛋白质,和,纤维状蛋白质,。,球状蛋白质,(,globular,protein,),血红蛋白、肌红,蛋白等。,8/92,纤维状蛋白质(,fibroue protein,),胶原蛋白、弹性 蛋白、角蛋白、丝心蛋白等。,9/92,催化蛋白(酶),调整蛋白,结构蛋白,运输蛋白,贮藏蛋白,运动蛋白,防御蛋白,电子传递蛋白,2.按蛋白质功效分类,10/92,3.,按蛋白质组成和溶解性分类,单纯蛋白质,(,simple protein,),结合蛋白质,(,complex protein,),11/92,二、蛋白质基本组成单位,氨基酸,(一)氨基酸结构,(二)氨基酸分类,(三)氨基酸性质,12/92,(一)氨基酸结构,蛋白质基本结构单位,-,氨基酸结构通式,侧链,13/92,脯氨酸,亚氨基,14/92,(二)氨基酸分类,1,.,编码氨基酸,2.非编码氨基酸,3.,非蛋白质氨基酸,15/92,氨基酸名称,符号,R,基化学结构,等电点,分类,H,3,C,H,3,C,Ala,(,alanine,),CH,CH,3,H,3,C,CH,CH,3,CH,2,H,3,C,CH,CH,3,CH,2,H,3,C,CH,2,N,CH,2,CH,2,CH,2,S,CH,2,H,2,C,H,2,C,CH,N,COOH,H,缬氨酸,亮氨酸,苯丙氨酸,色氨酸,蛋氨酸,脯氨酸,Val,Pro,Trp,Met,Leu,Ile,Phe,异亮氨酸,(,valine),(,leucine),(,phenylalanine),(,tryptophan),(,methionine),(,proline),(,isoleucine),6.02,5.97,5.98,6.02,5.48,5.89,5.75,6.30,非极性氨基酸,(8种),丙氨酸,1.,编码氨基酸,16/92,17/92,第,21,种氨基酸,硒代半胱氨酸,18/92,2.,非编码氨基酸,没有对应三联体遗传密码。,由,编码氨基酸,经羟基化、甲基化、磷酸化等修饰形成衍生物。,比如:胶原蛋白和弹性蛋白中,4-羟脯氨酸,、,5-,羟赖氨酸等,。,19/92,3.,非蛋白质氨基酸,在生物体内,还发觉,150,各种不参加蛋白质组成氨基酸。,这些非蛋白质氨基酸多是,主要代谢物前体或代谢中间产物,。,20/92,1.,氨基酸两性解离及等电点,氨基酸是,两性电解质,(,ampholyte),C,H,COOH,R,NH,2,(三)氨基酸性质,21/92,氨基酸两性解离,R,COOH,C,H,NH,2,R,COO,C,H,NH,3,+,-,中性分子形式,两性离子形式,22/92,R,COOH,C,H,NH,3,R,COO,-,C,H,NH,3,+,R,COO,-,C,H,NH,2,+,OH,-,H+,23/92,对某种氨基酸来讲,当溶液在某一特定,pH,时,氨基酸所带净电荷为零(即正电荷数与负电荷数相等),在电场中,既不向正极移动,也不向负极移动。这时,溶液,pH,称为该氨基酸等电点,(isoelectric point),,用,pI,表示。,两性解离物质所带静电荷为零时溶液,pH。,氨基酸等电点,24/92,(1)不一样氨基酸,因为,R,基团结构不一样,有不一样等电点。在一定试验条件下,等电点是,氨基酸特征常数,。,(2)当氨基酸处于等电点状态时,其,溶解度最小,,轻易发生沉淀。,利用这一特征,能够从各种氨基酸混合物溶液中,分离制取某种氨基酸,。,氨基酸等电点作用,25/92,(,1,)氨基酸构型,除,甘氨酸以外,,其余 20 种氨基酸,C,都是不对称碳原子(手性)。,2.,氨基酸光学活性与吸收光谱,26/92,甘氨酸结构式,27/92,参加蛋白质组成氨基酸在,可见光区都没有光吸收,;,在,紫外光区,只,有色氨酸、酪氨酸,和,苯丙氨酸,有吸收光能力。其最大吸收波长(,),分别为,280,nm,、275,nm,、257,nm,;,是,利用紫外分光光度计,,在280,nm,波优点,,测定蛋白质浓度基础。,(,2,)吸收光谱,28/92,三、蛋白质结构,(一)蛋白质一级结构,(二)蛋白质三维结构,29/92,蛋白质结构层次,30/92,一级结构(,primary structure,);,二级结构(,secondary structure);,超二级结构(,supersecondary,structure);,结构域(,structural domain);,三级结构(,tertiary structure);,四级结构(,quarternary structure),蛋白质结构层次,31/92,(一)蛋白质一级结构,概念:,多肽链上各种,氨基酸残基,排列次序,即氨基酸序列称为蛋白质一级结构(,primary structure,)。,(51,Aa,5733 u),32/92,1.,肽和肽键,肽,由,氨基酸组成线形聚合物,称为肽(,peptide)。,二个氨基酸分子缩合而成肽,称为二肽(,dipeptide),。,N,H,C,O,C,N,H,C,O,C,OH,H,H,R,1,R,2,H,33/92,34/92,肽键,(,peptide bone),多肽链,(,polypeptide chain),肽键氮氧原子共振产生:,(1)部分双键性质;(2)多肽主链酰胺平面;(3),C,处于顺式或反式构型;(4)二面角;(5)偶极性(,N,末端,,C,末端),。,35/92,氨基酸残基,(,amino acid residue),H,OH,36/92,蛋白质一级结构表示法,肽键,H,2,N,CO,H,CH,3,S,COOH,NH,C,CO,H,NH,C,CO,H,NH,C,CO,H,NH,C,H,H,CH,2,C,H,CH,2,OH,CH,2,CH,2,汉字氨基酸残基命名法:,酪氨酰甘氨酰甘氨酰苯丙,氨酰甲硫氨酸,三字母符号表示法,:,TyrGlyGlyPheMet,单字母,符号表示法,:,YGGFM,37/92,谷胱甘肽,脑啡肽(5肽,),短杆菌肽,S(10,肽,),肽类激素,3.天然活性肽,38/92,(二)蛋白质三维结构,蛋白 质三维结构,指是,蛋白质分子中全部原子和基团相互间立体关系,包含全部原子和基团排列、分布及肽链走向。,又称为蛋白质高级结构、空间结构或构象,可分为,二级,、,超二级,、,结构域,、,三级,和,四级结构,。,39/92,1,.,蛋白质二级结构,2.蛋白质超二级结构和结构域,3.蛋白质三级结构,4,.,蛋白质四级结构,5,.,稳定蛋白质构象作用力,40/92,蛋白质结构层次,41/92,1.基本知识,(1)构型与构象,构型(,configuration),构象(,conformation)1969,年,,IUPAC,(2),蛋白质立体结构原理,肽单位与二面角,将多肽链基本结构中,-,C,-CO-NH-C,-,这一主链骨架重复单位叫,肽单位,(,Pauling,和,Corey,在1951年依据,X-,射线衍射结果,提出蛋白质,肽单位平面标准,3,),。,42/92,肽单位平面结构,N,H,C,O,C,N,H,C,O,C,OH,H,H,R,1,R,2,H,43/92,肽单位立体结构,44/92,45/92,二面角(,dihedral angle),肽平面1 围绕,C,2,N,1,单键旋转,其旋转角度用,表示;,肽平面2 也能够围绕,C,2,C,2,单键旋转,其旋转角度用,表示。,(,右为正,左为负,),N1,C,2,C2,46/92,多肽链主链骨架构象是由每个,C,成对二面角,(,,,),所决定。,非键合原子间最小接触距离,在相邻两个肽单位构象中,非键合原子间靠近有没有障碍,是否符合,标准接触距离,,,即能量是否到达最低,,,也是肽链构象能否稳定存在主要,立体化学标准,。,47/92,2.,二级结构,概 念,指多肽链主链在一级结构基础上,一些肽段借助氢键深入盘旋或折叠,从而形成有规律构象。,主要类型,-,螺旋、,-,折叠片、,-,转角、无规卷曲。,48/92,(,1,),-,螺旋,即每个氨基酸残基(,n),CO,与另一个氨基酸残基(,n+4),NH,形成氢键。,Pauling,和,Corey,于1951 年提出蛋白质,-,螺旋,(,-helix,),结构模型,。,羊毛等纤维状蛋白质中,球状蛋白中也广泛存在。它是蛋白质主链一个经典结构形式,.,49/92,每隔,3.6,个氨基酸残基,螺旋上升一圈,每圈间距,0.54nm.,氢键环内包含,13,个主链原子,所以称这种螺旋为,3.6,13,螺旋。,50/92,51/92,52/92,53/92,电子显微镜下人体头发,54/92,(,2,),-,折叠,(,a)Antiparallel,-,折叠:,伸展多肽链靠氢键联结而成锯齿状片层结构,存在于纤维蛋白,球状蛋白也有。,又称为,-,折叠片(,-pleated sheet),。,55/92,反平行式较为稳定,比如在丝心蛋白中存在稳定反平行,折叠。,56/92,(,3,),-,转角,蛋白质分子中连接不一样结构单位180,o,转弯结构称为,-,转角(,-turn),。,由氨基酸残基(,n),CO,与另一个氨基酸残基(,n+3),NH,形成氢键。,57/92,(,4,)无规卷曲,没有规律性多肽主链骨架构象,就是,无规卷曲,(,random coil,,,、,角度,不定);球蛋白分子中,往往含有较多无规卷曲;无规卷曲,往往,有利于多肽链形成灵活、含有特异生物活性构象。,58/92,(,1,)超二级结构,相邻二级结构单元(主要是,螺旋和,折叠)组合在一起,形成有规则、空间上能够识别,二级结构组合体,,充当三级结构构件,称为,超二级结构(,supersecondary structure),。,3.超二级结构和结构域,59/92,常见组合形式:,、,60/92,(,2,)结构域,多肽链在二级结构或超二级结构基础上,深入卷波折叠成为相对独立、近似球形三维实体称为,结构域(,structure domain),,,是三级结构局部折叠区。,61/92,结构域之间经常只有一段肽链相连,形成所谓“,铰链区,”(,hinge region),,使结构域轻易发生相对运动。结构域之间这种,柔性,(,flexibility),有利于如酶和抗体活性发挥。,62/92,4.三级结构,多肽链在二级结构、超二级结构和结构域基础上,,主链构象和侧链构象相互作用,,深入盘波折叠形成特定球状分子结构,称作三级结构,(tertiary,structure),。,三级结构是指多肽链中全部原子空间排布。,肌红蛋白,myoglobin,63/92,5.,四级结构,由两条或两条以上含有三级结构多肽链聚合而成特定三维结构(构象)称为蛋白质四级结构,(quarter-nary struc-ture),。,包括亚基种类、数目和亚基空间排布,包含亚基间接触位点和相互作用关系,但不包含亚基本身构象。,-,亚基,(,subunit),血红蛋白,hemoglobin,-,亚基,血红素,(,haem,),64/92,烟草花叶病毒(,TMV),示意图,由2 130个相同亚基组成螺旋对称性柱形蛋白质外壳,紧密排列于一含有6 390个核苷酸单链,RNA,分子周围。解离,TMV,外壳亚基和,RNA,,在适当条件下能,自装配,成完整,TMV。,65/92,蛋白质结构层次,66/92,5,.,稳定蛋白质构象作用力,67/92,四、蛋白质结构与功效关系,(一)蛋白质一级结构与功效关系,(二)蛋白质构象与功效关系,68/92,1.一级结构变异与生物进化,在不一样生物体中行使相同或相同功效蛋白质,称为,同功效蛋白质,。,它们氨基酸序列含有显著相同性,这种现象称为,序列同源,,有显著序列同源蛋白质,也称,同源蛋白质,。,(一)蛋白质一级结构与功效关系,69/92,(1)同源蛋白质完全相同氨基酸残基,称,不变残基,,它们决定了蛋白质,空间结构与功效,。,(2)有相当大改变氨基酸残基,称为,可变残基,,它们差异表达了,种属特异性,。,所以,对不一样生物起源,同功效蛋白质,一级结构进行比较研究:,能够帮助我们了解哪些氨基酸对其活性是主要,哪些是不主要;可为生物进化提供新可靠依据。,同源蛋白质结构种属差异与保守性,70/92,2.,一级结构变异与分子病,(,1,)分子病,基因突变,Aa,变异 蛋白结构和功效改变引发遗传病。,(,2,)镰刀型红细胞贫血病,由,Hb,分子,亚基,N,末端序列一级结构改变引发,Hb,表面电荷和等电点改变,溶解度降低并出现不正常线形缔合。,71/92,正常红细胞和镰刀状红细胞扫描电镜图谱,?,72/92,一级结构相同,可能会有相同功效;一级结构有差异,功效会不一样。如,OX,与,ADH:,牛催产素,Cys.Tyr.,Ile,.Gln.Asn.Cys.Pro.,Leu,.Gly-NH,2,Cys.Tyr.,Phe,.Gln.Asn.Cys.Pro.,Arg,.Gly-NH,2,.,S,S,1,2,3,4,5,6,7,8,9,S,S,牛加压素,3.,多肽激素一级结构与功效,(,ADH,),(,OX,),73/92,不一样生物(哺乳动物、鸟类、鱼类)起源胰岛素分子一级结构,发觉组成,51,个氨基酸残基中,只有,24,个氨基酸残基一直保持不变,为不一样生物所共有,为维持高级结构和生物活性所必需。,4.,不一样生物起源胰岛素一级结构比较,74/92,5.,一级结构断裂与功效激活,有些蛋白质常以无活性前体形式产生和贮存。在机体需要时,切去部分肽段之后,才变成有活性蛋白质。,如参加蛋白质消化各种蛋白酶、参加血液凝固凝血酶、凝血因子等。,激活,(,activation):,使前体蛋白质变成活性蛋白质过程,称为激活,。,75/92,76/92,(二)蛋白质构象与功效关系,1,.,变构调整活性,2,.,变性丧失活性,77/92,血红蛋白,-,亚基,-,亚基,(,-,subunit),血红素,(,haem,),78/92,血红蛋白变构现象(变构时亚基移动),79/92,血红蛋白和肌红蛋白氧合曲线不一样,前者是,S,形曲线,后者是双曲线。,-,亚基可与氧结合,而,-,亚基因为存在空间位阻,几乎不与氧结合。当,-,亚基与氧结合后,发生三级结构改变,此改变使相邻,-,亚基发生三级结构改变,与氧结合使血红蛋白结合氧能力在短时间内快速上升,从,而使,曲线程,S,形。,氧饱和度(,%,),80/92,(一)蛋白质主要性质,(二)蛋白质分离纯化标准与方法,五、蛋白质主要性质、分离纯化与判定,81/92,1,.,蛋白质两性解离与等电点,2,.,蛋白质变性与复性,3,.,蛋白质呈色反应,(一)蛋白质主要性质,82/92,蛋白质等电点(,isoelectric point),当溶液在某个,pH,时,使蛋白质分子所带正电荷数与负电荷数恰好相等,即净电荷为零,在直流电场中,既不向阳极移动,也不向阴极移动,此时溶液,pH,就是该蛋白质等电点,,,用,pI,表示。,两性解离物质所带静电荷为零时溶液,pH。,1.蛋白质两性解离与等电点,83/92,(,1,)蛋白质变性,天然蛋白质在变性原因作用之下,其,一级结构保持不变,但其高级结构发生了异常改变,,即由天然态(折叠态)变成了变性态(伸展态),从而,引发生物功效丧失,物理、化学性质也发生改变,,这种现象被称为,变性(,denaturation),。,2.,蛋白质变性与复性,84/92,引发变性原因:,物理原因和化学原因。,1.热(60100);2.,pH,;3.盐;4.有机溶剂;5.尿素与盐酸胍;6.去垢剂等,85/92,变性表现:,(1)物理性质改变:,溶解度下降;(,2)化学性质改变:,易被蛋白酶消化;(3),生物功效改变:,酶丧失活性、激素蛋白丧失生理调整作用、抗体失去与抗原专一性结合能力。,变性机理:,破坏了蛋白质分子构象中次级键。,使原来埋藏在分子内部疏水集团大量暴露出来,使分子表面水化膜破坏,分子结合沉淀。,86/92,以天然蛋白质作对照,测定蛋白质,物理改变,观察蛋白质溶解度是否下,降,是否凝集、沉淀等;,测定蛋白质化学性质改变;,测定蛋白质比活性。,蛋白质变性判定方法,87/92,蛋白质变性有可逆变性和不可逆变性之分。,可逆变性,在除去变性原因之后,在适宜条件下,变性蛋白质能够从伸展态恢复到折叠态,并恢复全部生物活性现象,称之为,复性(,renaturation)。,(,2,)复性,88/92,3.,蛋白质呈色反应,蛋白质分子结构中自由 一,NH,2,、,一,COOH,和肽键,以及一些氨基酸侧链基团,能够与某种化学试剂发生反应,产生有色物质。,89/92,蛋白质主要呈色反应,90/92,1.,标准,2.,方法,(1)前处理,(2)沉淀分离,(3)分离纯化,(4)质量判定,(二)蛋白质分离纯化标准与方法,91/92,思索题,1.,蛋白质分为哪些类型?各行使何种功效?,2.,自然界存在氨基酸种类、结构、性质?,3.,肽键有何特点?对蛋白质构象形成有何,影响?,4.,何谓蛋白质一、二、三、四级结构?维,系蛋白质构象作用力有哪些?,5.,何谓蛋白质超二级结构和结构域?,6.,试述蛋白质一级结构和高级结构与功效,关系。,7.,何谓蛋白质变性作用与复性作用?,92/92,展开阅读全文
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